Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gpbp1l1Q6NZP2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gpbp1l1Q6NZP2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gpbp1l1Q6NZP2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gpbp1l1Q6NZP2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Gpbp1l1Q6NZP2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Gpbp1l1Q6NZP2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Gpbp1l1Q6NZP2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gpbp1l1Q6NZP2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gpbp1l1Q6NZP2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gpbp1l1Q6NZP2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gpbp1l1Q6NZP2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gpbp1l1Q6NZP2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gpbp1l1Q6NZP2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gpbp1l1Q6NZP2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gpbp1l1Q6NZP2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gpbp1l1Q6NZP2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gpbp1l1Q6NZP2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gpbp1l1Q6NZP2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gpbp1l1Q6NZP2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gpbp1l1Q6NZP2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gpbp1l1Q6NZP2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gpbp1l1Q6NZP2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gpbp1l1Q6NZP2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gpbp1l1Q6NZP2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gpbp1l1Q6NZP2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Gpbp1l1Q6NZP2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gpbp1l1Q6NZP2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Gpbp1l1Q6NZP2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gpbp1l1Q6NZP2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gpbp1l1Q6NZP2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gpbp1l1Q6NZP2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gpbp1l1Q6NZP2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gpbp1l1Q6NZP2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gpbp1l1Q6NZP2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gpbp1l1Q6NZP2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gpbp1l1Q6NZP2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Gpbp1l1Q6NZP2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gpbp1l1Q6NZP2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gpbp1l1Q6NZP2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Gpbp1l1Q6NZP2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms