Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc8eQ66JT1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc8eQ66JT1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc8eQ66JT1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc8eQ66JT1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc8eQ66JT1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc8eQ66JT1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc8eQ66JT1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc8eQ66JT1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc8eQ66JT1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc8eQ66JT1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrc8eQ66JT1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Lrrc8eQ66JT1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrc8eQ66JT1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrc8eQ66JT1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lrrc8eQ66JT1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lrrc8eQ66JT1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrc8eQ66JT1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrc8eQ66JT1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrc8eQ66JT1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrc8eQ66JT1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrc8eQ66JT1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrc8eQ66JT1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrc8eQ66JT1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrc8eQ66JT1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrc8eQ66JT1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrc8eQ66JT1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrc8eQ66JT1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrc8eQ66JT1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrc8eQ66JT1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrc8eQ66JT1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc8eQ66JT1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc8eQ66JT1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc8eQ66JT1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc8eQ66JT1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc8eQ66JT1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc8eQ66JT1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrc8eQ66JT1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrc8eQ66JT1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrc8eQ66JT1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrc8eQ66JT1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrc8eQ66JT1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrc8eQ66JT1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrc8eQ66JT1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrc8eQ66JT1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrc8eQ66JT1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrc8eQ66JT1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrc8eQ66JT1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrc8eQ66JT1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrc8eQ66JT1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrc8eQ66JT1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrc8eQ66JT1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrc8eQ66JT1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrc8eQ66JT1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrc8eQ66JT1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrc8eQ66JT1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrc8eQ66JT1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrc8eQ66JT1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrc8eQ66JT1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrc8eQ66JT1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrc8eQ66JT1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrc8eQ66JT1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrc8eQ66JT1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrc8eQ66JT1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrc8eQ66JT1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrc8eQ66JT1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrc8eQ66JT1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrc8eQ66JT1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrc8eQ66JT1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrc8eQ66JT1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrc8eQ66JT1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrc8eQ66JT1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrc8eQ66JT1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrc8eQ66JT1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrc8eQ66JT1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrc8eQ66JT1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrc8eQ66JT1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrc8eQ66JT1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrc8eQ66JT1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrc8eQ66JT1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrc8eQ66JT1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrc8eQ66JT1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrc8eQ66JT1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrc8eQ66JT1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc8eQ66JT1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc8eQ66JT1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc8eQ66JT1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc8eQ66JT1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc8eQ66JT1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lrrc8eQ66JT1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrrc8eQ66JT1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrrc8eQ66JT1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrrc8eQ66JT1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrrc8eQ66JT1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrrc8eQ66JT1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrc8eQ66JT1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrc8eQ66JT1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrc8eQ66JT1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrc8eQ66JT1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrc8eQ66JT1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms