Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ctnna3Q65CL1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ctnna3Q65CL1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ctnna3Q65CL1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ctnna3Q65CL1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ctnna3Q65CL1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ctnna3Q65CL1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ctnna3Q65CL1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ctnna3Q65CL1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ctnna3Q65CL1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ctnna3Q65CL1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ctnna3Q65CL1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ctnna3Q65CL1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ctnna3Q65CL1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ctnna3Q65CL1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ctnna3Q65CL1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ctnna3Q65CL1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ctnna3Q65CL1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ctnna3Q65CL1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ctnna3Q65CL1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ctnna3Q65CL1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ctnna3Q65CL1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ctnna3Q65CL1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ctnna3Q65CL1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ctnna3Q65CL1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ctnna3Q65CL1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ctnna3Q65CL1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ctnna3Q65CL1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ctnna3Q65CL1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ctnna3Q65CL1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ctnna3Q65CL1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ctnna3Q65CL1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ctnna3Q65CL1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ctnna3Q65CL1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ctnna3Q65CL1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ctnna3Q65CL1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ctnna3Q65CL1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ctnna3Q65CL1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ctnna3Q65CL1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ctnna3Q65CL1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ctnna3Q65CL1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ctnna3Q65CL1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ctnna3Q65CL1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ctnna3Q65CL1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ctnna3Q65CL1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ctnna3Q65CL1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ctnna3Q65CL1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ctnna3Q65CL1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ctnna3Q65CL1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ctnna3Q65CL1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ctnna3Q65CL1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ctnna3Q65CL1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ctnna3Q65CL1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ctnna3Q65CL1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ctnna3Q65CL1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ctnna3Q65CL1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ctnna3Q65CL1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ctnna3Q65CL1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ctnna3Q65CL1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ctnna3Q65CL1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ctnna3Q65CL1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ctnna3Q65CL1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ctnna3Q65CL1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ctnna3Q65CL1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ctnna3Q65CL1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ctnna3Q65CL1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ctnna3Q65CL1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ctnna3Q65CL1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ctnna3Q65CL1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ctnna3Q65CL1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ctnna3Q65CL1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ctnna3Q65CL1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ctnna3Q65CL1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ctnna3Q65CL1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ctnna3Q65CL1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ctnna3Q65CL1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ctnna3Q65CL1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ctnna3Q65CL1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ctnna3Q65CL1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ctnna3Q65CL1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ctnna3Q65CL1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ctnna3Q65CL1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ctnna3Q65CL1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ctnna3Q65CL1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ctnna3Q65CL1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ctnna3Q65CL1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ctnna3Q65CL1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ctnna3Q65CL1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ctnna3Q65CL1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ctnna3Q65CL1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ctnna3Q65CL1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ctnna3Q65CL1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ctnna3Q65CL1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ctnna3Q65CL1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ctnna3Q65CL1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ctnna3Q65CL1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ctnna3Q65CL1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ctnna3Q65CL1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ctnna3Q65CL1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ctnna3Q65CL1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.8 ms