Protein–RNA interactions for Protein: Q64519

Sdc3, Syndecan-3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc3Q64519 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sdc3Q64519 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sdc3Q64519 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sdc3Q64519 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sdc3Q64519 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sdc3Q64519 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sdc3Q64519 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sdc3Q64519 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sdc3Q64519 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sdc3Q64519 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sdc3Q64519 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sdc3Q64519 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sdc3Q64519 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sdc3Q64519 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sdc3Q64519 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sdc3Q64519 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sdc3Q64519 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sdc3Q64519 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sdc3Q64519 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sdc3Q64519 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sdc3Q64519 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sdc3Q64519 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sdc3Q64519 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sdc3Q64519 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sdc3Q64519 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sdc3Q64519 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sdc3Q64519 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sdc3Q64519 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sdc3Q64519 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Sdc3Q64519 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sdc3Q64519 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sdc3Q64519 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Sdc3Q64519 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sdc3Q64519 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sdc3Q64519 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sdc3Q64519 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sdc3Q64519 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sdc3Q64519 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sdc3Q64519 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sdc3Q64519 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sdc3Q64519 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sdc3Q64519 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sdc3Q64519 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sdc3Q64519 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sdc3Q64519 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sdc3Q64519 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sdc3Q64519 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sdc3Q64519 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sdc3Q64519 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sdc3Q64519 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sdc3Q64519 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sdc3Q64519 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sdc3Q64519 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sdc3Q64519 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sdc3Q64519 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sdc3Q64519 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sdc3Q64519 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sdc3Q64519 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sdc3Q64519 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sdc3Q64519 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sdc3Q64519 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sdc3Q64519 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sdc3Q64519 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sdc3Q64519 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sdc3Q64519 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sdc3Q64519 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sdc3Q64519 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sdc3Q64519 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sdc3Q64519 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sdc3Q64519 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sdc3Q64519 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sdc3Q64519 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sdc3Q64519 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sdc3Q64519 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sdc3Q64519 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sdc3Q64519 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sdc3Q64519 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sdc3Q64519 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sdc3Q64519 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sdc3Q64519 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sdc3Q64519 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sdc3Q64519 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sdc3Q64519 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sdc3Q64519 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sdc3Q64519 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sdc3Q64519 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sdc3Q64519 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sdc3Q64519 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sdc3Q64519 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sdc3Q64519 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sdc3Q64519 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sdc3Q64519 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sdc3Q64519 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sdc3Q64519 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sdc3Q64519 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sdc3Q64519 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sdc3Q64519 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sdc3Q64519 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sdc3Q64519 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sdc3Q64519 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms