Protein–RNA interactions for Protein: Q62472

Lcn4, Vomeronasal secretory protein 2, mousemouse

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn4Q62472 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lcn4Q62472 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lcn4Q62472 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lcn4Q62472 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lcn4Q62472 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lcn4Q62472 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lcn4Q62472 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lcn4Q62472 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lcn4Q62472 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lcn4Q62472 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lcn4Q62472 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lcn4Q62472 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lcn4Q62472 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lcn4Q62472 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lcn4Q62472 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lcn4Q62472 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lcn4Q62472 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lcn4Q62472 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lcn4Q62472 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lcn4Q62472 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Lcn4Q62472 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lcn4Q62472 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lcn4Q62472 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lcn4Q62472 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lcn4Q62472 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lcn4Q62472 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lcn4Q62472 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lcn4Q62472 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lcn4Q62472 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lcn4Q62472 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lcn4Q62472 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Lcn4Q62472 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lcn4Q62472 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lcn4Q62472 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lcn4Q62472 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lcn4Q62472 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lcn4Q62472 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lcn4Q62472 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lcn4Q62472 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lcn4Q62472 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lcn4Q62472 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lcn4Q62472 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
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Lcn4Q62472 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lcn4Q62472 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lcn4Q62472 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lcn4Q62472 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lcn4Q62472 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Lcn4Q62472 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lcn4Q62472 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Lcn4Q62472 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lcn4Q62472 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lcn4Q62472 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Lcn4Q62472 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Lcn4Q62472 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Lcn4Q62472 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lcn4Q62472 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lcn4Q62472 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lcn4Q62472 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lcn4Q62472 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Lcn4Q62472 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lcn4Q62472 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lcn4Q62472 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lcn4Q62472 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lcn4Q62472 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lcn4Q62472 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lcn4Q62472 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lcn4Q62472 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lcn4Q62472 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lcn4Q62472 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lcn4Q62472 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Lcn4Q62472 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lcn4Q62472 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lcn4Q62472 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lcn4Q62472 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lcn4Q62472 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lcn4Q62472 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lcn4Q62472 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lcn4Q62472 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Lcn4Q62472 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lcn4Q62472 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lcn4Q62472 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lcn4Q62472 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lcn4Q62472 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lcn4Q62472 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
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