Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itga3Q62470 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itga3Q62470 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Itga3Q62470 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itga3Q62470 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Itga3Q62470 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itga3Q62470 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itga3Q62470 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itga3Q62470 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itga3Q62470 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itga3Q62470 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itga3Q62470 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itga3Q62470 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itga3Q62470 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itga3Q62470 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itga3Q62470 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itga3Q62470 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itga3Q62470 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itga3Q62470 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itga3Q62470 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itga3Q62470 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itga3Q62470 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itga3Q62470 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Itga3Q62470 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Itga3Q62470 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itga3Q62470 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itga3Q62470 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itga3Q62470 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itga3Q62470 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itga3Q62470 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itga3Q62470 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itga3Q62470 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itga3Q62470 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itga3Q62470 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Itga3Q62470 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itga3Q62470 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itga3Q62470 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itga3Q62470 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itga3Q62470 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Itga3Q62470 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itga3Q62470 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itga3Q62470 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itga3Q62470 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itga3Q62470 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itga3Q62470 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Itga3Q62470 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Itga3Q62470 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itga3Q62470 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itga3Q62470 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itga3Q62470 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itga3Q62470 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itga3Q62470 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itga3Q62470 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itga3Q62470 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itga3Q62470 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itga3Q62470 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itga3Q62470 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Itga3Q62470 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itga3Q62470 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itga3Q62470 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itga3Q62470 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itga3Q62470 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itga3Q62470 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itga3Q62470 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itga3Q62470 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itga3Q62470 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itga3Q62470 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itga3Q62470 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itga3Q62470 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itga3Q62470 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itga3Q62470 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itga3Q62470 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itga3Q62470 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itga3Q62470 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itga3Q62470 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itga3Q62470 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itga3Q62470 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itga3Q62470 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itga3Q62470 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itga3Q62470 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itga3Q62470 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itga3Q62470 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itga3Q62470 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itga3Q62470 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Itga3Q62470 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itga3Q62470 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itga3Q62470 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itga3Q62470 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Itga3Q62470 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Itga3Q62470 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Itga3Q62470 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itga3Q62470 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itga3Q62470 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itga3Q62470 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Itga3Q62470 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itga3Q62470 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itga3Q62470 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itga3Q62470 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itga3Q62470 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itga3Q62470 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms