Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vat1Q62465 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vat1Q62465 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vat1Q62465 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vat1Q62465 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vat1Q62465 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vat1Q62465 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
Vat1Q62465 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vat1Q62465 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vat1Q62465 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vat1Q62465 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vat1Q62465 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Vat1Q62465 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vat1Q62465 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vat1Q62465 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Vat1Q62465 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vat1Q62465 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vat1Q62465 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Vat1Q62465 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vat1Q62465 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Vat1Q62465 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vat1Q62465 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vat1Q62465 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vat1Q62465 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vat1Q62465 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vat1Q62465 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vat1Q62465 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vat1Q62465 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vat1Q62465 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vat1Q62465 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vat1Q62465 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vat1Q62465 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vat1Q62465 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vat1Q62465 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vat1Q62465 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vat1Q62465 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vat1Q62465 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vat1Q62465 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vat1Q62465 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Vat1Q62465 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vat1Q62465 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vat1Q62465 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vat1Q62465 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vat1Q62465 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vat1Q62465 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Vat1Q62465 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vat1Q62465 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vat1Q62465 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vat1Q62465 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vat1Q62465 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vat1Q62465 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vat1Q62465 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vat1Q62465 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vat1Q62465 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vat1Q62465 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vat1Q62465 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vat1Q62465 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Vat1Q62465 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vat1Q62465 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vat1Q62465 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vat1Q62465 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vat1Q62465 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vat1Q62465 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vat1Q62465 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vat1Q62465 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vat1Q62465 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vat1Q62465 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Vat1Q62465 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vat1Q62465 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vat1Q62465 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vat1Q62465 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vat1Q62465 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Vat1Q62465 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vat1Q62465 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vat1Q62465 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vat1Q62465 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vat1Q62465 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vat1Q62465 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vat1Q62465 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vat1Q62465 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vat1Q62465 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vat1Q62465 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vat1Q62465 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vat1Q62465 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vat1Q62465 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vat1Q62465 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Vat1Q62465 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Vat1Q62465 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vat1Q62465 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vat1Q62465 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vat1Q62465 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vat1Q62465 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vat1Q62465 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vat1Q62465 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vat1Q62465 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vat1Q62465 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vat1Q62465 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vat1Q62465 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vat1Q62465 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vat1Q62465 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms