Protein–RNA interactions for Protein: Q62447

Ccnc, Cyclin-C, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcncQ62447 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CcncQ62447 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CcncQ62447 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CcncQ62447 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CcncQ62447 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CcncQ62447 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CcncQ62447 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CcncQ62447 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CcncQ62447 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CcncQ62447 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CcncQ62447 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CcncQ62447 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CcncQ62447 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CcncQ62447 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CcncQ62447 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CcncQ62447 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CcncQ62447 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CcncQ62447 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CcncQ62447 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CcncQ62447 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CcncQ62447 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CcncQ62447 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CcncQ62447 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CcncQ62447 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CcncQ62447 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CcncQ62447 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CcncQ62447 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CcncQ62447 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CcncQ62447 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CcncQ62447 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CcncQ62447 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CcncQ62447 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CcncQ62447 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CcncQ62447 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CcncQ62447 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CcncQ62447 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CcncQ62447 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CcncQ62447 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CcncQ62447 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CcncQ62447 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CcncQ62447 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CcncQ62447 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CcncQ62447 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CcncQ62447 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CcncQ62447 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CcncQ62447 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CcncQ62447 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CcncQ62447 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CcncQ62447 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CcncQ62447 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CcncQ62447 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CcncQ62447 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CcncQ62447 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CcncQ62447 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CcncQ62447 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CcncQ62447 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CcncQ62447 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CcncQ62447 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CcncQ62447 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CcncQ62447 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CcncQ62447 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CcncQ62447 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CcncQ62447 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CcncQ62447 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CcncQ62447 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CcncQ62447 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CcncQ62447 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CcncQ62447 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CcncQ62447 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CcncQ62447 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CcncQ62447 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CcncQ62447 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CcncQ62447 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CcncQ62447 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CcncQ62447 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CcncQ62447 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CcncQ62447 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CcncQ62447 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CcncQ62447 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CcncQ62447 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CcncQ62447 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CcncQ62447 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CcncQ62447 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CcncQ62447 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CcncQ62447 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CcncQ62447 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CcncQ62447 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CcncQ62447 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CcncQ62447 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CcncQ62447 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CcncQ62447 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CcncQ62447 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CcncQ62447 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CcncQ62447 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CcncQ62447 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CcncQ62447 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CcncQ62447 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CcncQ62447 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CcncQ62447 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CcncQ62447 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms