Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
Kdm5dQ62240 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
Kdm5dQ62240 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
Kdm5dQ62240 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
Kdm5dQ62240 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
Kdm5dQ62240 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
Kdm5dQ62240 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
Kdm5dQ62240 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.58■■■■■ 4.25
Kdm5dQ62240 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC41.58■■■■■ 4.25
Kdm5dQ62240 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
Kdm5dQ62240 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC41.56■■■■■ 4.24
Kdm5dQ62240 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.56■■■■■ 4.24
Kdm5dQ62240 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
Kdm5dQ62240 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.56■■■■■ 4.24
Kdm5dQ62240 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC41.55■■■■■ 4.24
Kdm5dQ62240 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
Kdm5dQ62240 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC41.55■■■■■ 4.24
Kdm5dQ62240 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC41.55■■■■■ 4.24
Kdm5dQ62240 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC41.54■■■■■ 4.24
Kdm5dQ62240 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
Kdm5dQ62240 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC41.54■■■■■ 4.24
Kdm5dQ62240 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.52■■■■■ 4.24
Kdm5dQ62240 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.52■■■■■ 4.24
Kdm5dQ62240 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC41.51■■■■■ 4.24
Kdm5dQ62240 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
Kdm5dQ62240 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.49■■■■■ 4.23
Kdm5dQ62240 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC41.48■■■■■ 4.23
Kdm5dQ62240 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC41.48■■■■■ 4.23
Kdm5dQ62240 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
Kdm5dQ62240 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
Kdm5dQ62240 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
Kdm5dQ62240 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.47■■■■■ 4.23
Kdm5dQ62240 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
Kdm5dQ62240 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
Kdm5dQ62240 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.23
Kdm5dQ62240 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.43■■■■■ 4.22
Kdm5dQ62240 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC41.43■■■■■ 4.22
Kdm5dQ62240 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC41.42■■■■■ 4.22
Kdm5dQ62240 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
Kdm5dQ62240 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC41.42■■■■■ 4.22
Kdm5dQ62240 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC41.4■■■■■ 4.22
Kdm5dQ62240 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC41.4■■■■■ 4.22
Kdm5dQ62240 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
Kdm5dQ62240 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
Kdm5dQ62240 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC41.4■■■■■ 4.22
Kdm5dQ62240 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
Kdm5dQ62240 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.39■■■■■ 4.22
Kdm5dQ62240 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC41.39■■■■■ 4.22
Kdm5dQ62240 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
Kdm5dQ62240 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.22
Kdm5dQ62240 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
Kdm5dQ62240 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.37■■■■■ 4.21
Kdm5dQ62240 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
Kdm5dQ62240 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
Kdm5dQ62240 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC41.36■■■■■ 4.21
Kdm5dQ62240 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC41.35■■■■■ 4.21
Kdm5dQ62240 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
Kdm5dQ62240 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
Kdm5dQ62240 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
Kdm5dQ62240 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC41.35■■■■■ 4.21
Kdm5dQ62240 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
Kdm5dQ62240 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
Kdm5dQ62240 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
Kdm5dQ62240 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.33■■■■■ 4.21
Kdm5dQ62240 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
Kdm5dQ62240 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
Kdm5dQ62240 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
Kdm5dQ62240 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC41.33■■■■■ 4.21
Kdm5dQ62240 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC41.33■■■■■ 4.21
Kdm5dQ62240 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC41.33■■■■■ 4.21
Kdm5dQ62240 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
Kdm5dQ62240 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC41.32■■■■■ 4.21
Kdm5dQ62240 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
Kdm5dQ62240 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
Kdm5dQ62240 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
Kdm5dQ62240 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
Kdm5dQ62240 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
Kdm5dQ62240 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
Kdm5dQ62240 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
Kdm5dQ62240 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.31■■■■■ 4.2
Kdm5dQ62240 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC41.3■■■■■ 4.2
Kdm5dQ62240 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
Kdm5dQ62240 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
Kdm5dQ62240 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
Kdm5dQ62240 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
Kdm5dQ62240 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
Kdm5dQ62240 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
Kdm5dQ62240 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
Kdm5dQ62240 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
Kdm5dQ62240 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC41.28■■■■■ 4.2
Kdm5dQ62240 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC41.27■■■■■ 4.2
Kdm5dQ62240 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
Kdm5dQ62240 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC41.27■■■■■ 4.2
Kdm5dQ62240 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
Kdm5dQ62240 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC41.27■■■■■ 4.2
Kdm5dQ62240 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
Kdm5dQ62240 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
Kdm5dQ62240 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
Kdm5dQ62240 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
Kdm5dQ62240 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms