Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sema3cQ62181 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sema3cQ62181 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema3cQ62181 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema3cQ62181 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema3cQ62181 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema3cQ62181 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema3cQ62181 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema3cQ62181 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema3cQ62181 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema3cQ62181 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema3cQ62181 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema3cQ62181 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema3cQ62181 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema3cQ62181 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema3cQ62181 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema3cQ62181 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema3cQ62181 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema3cQ62181 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema3cQ62181 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema3cQ62181 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema3cQ62181 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema3cQ62181 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema3cQ62181 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema3cQ62181 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sema3cQ62181 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sema3cQ62181 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sema3cQ62181 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sema3cQ62181 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sema3cQ62181 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema3cQ62181 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema3cQ62181 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema3cQ62181 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema3cQ62181 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema3cQ62181 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema3cQ62181 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema3cQ62181 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema3cQ62181 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema3cQ62181 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema3cQ62181 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema3cQ62181 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema3cQ62181 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema3cQ62181 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema3cQ62181 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema3cQ62181 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema3cQ62181 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema3cQ62181 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema3cQ62181 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema3cQ62181 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema3cQ62181 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema3cQ62181 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema3cQ62181 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema3cQ62181 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Sema3cQ62181 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sema3cQ62181 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sema3cQ62181 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sema3cQ62181 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sema3cQ62181 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sema3cQ62181 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sema3cQ62181 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema3cQ62181 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema3cQ62181 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema3cQ62181 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema3cQ62181 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema3cQ62181 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema3cQ62181 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema3cQ62181 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema3cQ62181 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema3cQ62181 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema3cQ62181 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema3cQ62181 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema3cQ62181 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema3cQ62181 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema3cQ62181 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema3cQ62181 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema3cQ62181 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema3cQ62181 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema3cQ62181 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema3cQ62181 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema3cQ62181 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sema3cQ62181 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Sema3cQ62181 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sema3cQ62181 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sema3cQ62181 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema3cQ62181 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema3cQ62181 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema3cQ62181 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema3cQ62181 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema3cQ62181 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema3cQ62181 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema3cQ62181 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema3cQ62181 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema3cQ62181 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sema3cQ62181 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sema3cQ62181 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sema3cQ62181 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Sema3cQ62181 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sema3cQ62181 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sema3cQ62181 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sema3cQ62181 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms