Protein–RNA interactions for Protein: Q62179

Sema4b, Semaphorin-4B, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4bQ62179 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sema4bQ62179 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Sema4bQ62179 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sema4bQ62179 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sema4bQ62179 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sema4bQ62179 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sema4bQ62179 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sema4bQ62179 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sema4bQ62179 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema4bQ62179 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema4bQ62179 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema4bQ62179 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema4bQ62179 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sema4bQ62179 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sema4bQ62179 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sema4bQ62179 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Sema4bQ62179 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sema4bQ62179 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sema4bQ62179 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sema4bQ62179 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sema4bQ62179 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sema4bQ62179 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema4bQ62179 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema4bQ62179 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema4bQ62179 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema4bQ62179 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema4bQ62179 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema4bQ62179 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema4bQ62179 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sema4bQ62179 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sema4bQ62179 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sema4bQ62179 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sema4bQ62179 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sema4bQ62179 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sema4bQ62179 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sema4bQ62179 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Sema4bQ62179 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sema4bQ62179 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sema4bQ62179 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sema4bQ62179 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sema4bQ62179 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sema4bQ62179 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sema4bQ62179 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sema4bQ62179 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sema4bQ62179 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sema4bQ62179 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sema4bQ62179 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Sema4bQ62179 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sema4bQ62179 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sema4bQ62179 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sema4bQ62179 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sema4bQ62179 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sema4bQ62179 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sema4bQ62179 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sema4bQ62179 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sema4bQ62179 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sema4bQ62179 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sema4bQ62179 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sema4bQ62179 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sema4bQ62179 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sema4bQ62179 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sema4bQ62179 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sema4bQ62179 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sema4bQ62179 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sema4bQ62179 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Sema4bQ62179 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sema4bQ62179 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sema4bQ62179 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sema4bQ62179 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sema4bQ62179 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sema4bQ62179 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sema4bQ62179 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sema4bQ62179 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sema4bQ62179 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sema4bQ62179 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Sema4bQ62179 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sema4bQ62179 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sema4bQ62179 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sema4bQ62179 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sema4bQ62179 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sema4bQ62179 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sema4bQ62179 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Sema4bQ62179 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sema4bQ62179 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sema4bQ62179 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sema4bQ62179 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sema4bQ62179 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Sema4bQ62179 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sema4bQ62179 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sema4bQ62179 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sema4bQ62179 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sema4bQ62179 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sema4bQ62179 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sema4bQ62179 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sema4bQ62179 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sema4bQ62179 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sema4bQ62179 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sema4bQ62179 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sema4bQ62179 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sema4bQ62179 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms