Protein–RNA interactions for Protein: Q62167

Ddx3x, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx3xQ62167 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ddx3xQ62167 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ddx3xQ62167 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ddx3xQ62167 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ddx3xQ62167 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ddx3xQ62167 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ddx3xQ62167 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ddx3xQ62167 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ddx3xQ62167 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ddx3xQ62167 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ddx3xQ62167 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ddx3xQ62167 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ddx3xQ62167 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ddx3xQ62167 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ddx3xQ62167 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ddx3xQ62167 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ddx3xQ62167 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ddx3xQ62167 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ddx3xQ62167 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ddx3xQ62167 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ddx3xQ62167 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ddx3xQ62167 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ddx3xQ62167 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ddx3xQ62167 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ddx3xQ62167 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ddx3xQ62167 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ddx3xQ62167 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ddx3xQ62167 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ddx3xQ62167 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ddx3xQ62167 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ddx3xQ62167 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ddx3xQ62167 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ddx3xQ62167 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ddx3xQ62167 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ddx3xQ62167 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ddx3xQ62167 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ddx3xQ62167 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ddx3xQ62167 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ddx3xQ62167 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ddx3xQ62167 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ddx3xQ62167 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ddx3xQ62167 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ddx3xQ62167 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ddx3xQ62167 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ddx3xQ62167 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ddx3xQ62167 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ddx3xQ62167 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddx3xQ62167 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddx3xQ62167 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddx3xQ62167 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddx3xQ62167 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddx3xQ62167 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddx3xQ62167 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddx3xQ62167 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddx3xQ62167 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddx3xQ62167 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddx3xQ62167 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddx3xQ62167 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddx3xQ62167 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddx3xQ62167 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddx3xQ62167 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddx3xQ62167 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddx3xQ62167 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddx3xQ62167 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddx3xQ62167 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddx3xQ62167 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddx3xQ62167 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddx3xQ62167 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddx3xQ62167 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddx3xQ62167 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddx3xQ62167 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddx3xQ62167 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddx3xQ62167 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddx3xQ62167 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddx3xQ62167 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddx3xQ62167 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx3xQ62167 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx3xQ62167 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx3xQ62167 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx3xQ62167 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx3xQ62167 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx3xQ62167 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx3xQ62167 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx3xQ62167 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx3xQ62167 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx3xQ62167 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx3xQ62167 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx3xQ62167 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx3xQ62167 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx3xQ62167 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx3xQ62167 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx3xQ62167 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx3xQ62167 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx3xQ62167 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx3xQ62167 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx3xQ62167 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx3xQ62167 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx3xQ62167 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx3xQ62167 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx3xQ62167 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms