Protein–RNA interactions for Protein: Q61490

Alcam, CD166 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlcamQ61490 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AlcamQ61490 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AlcamQ61490 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AlcamQ61490 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AlcamQ61490 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AlcamQ61490 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AlcamQ61490 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AlcamQ61490 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
AlcamQ61490 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AlcamQ61490 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AlcamQ61490 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AlcamQ61490 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AlcamQ61490 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AlcamQ61490 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AlcamQ61490 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AlcamQ61490 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AlcamQ61490 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AlcamQ61490 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
AlcamQ61490 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AlcamQ61490 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AlcamQ61490 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AlcamQ61490 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AlcamQ61490 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AlcamQ61490 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AlcamQ61490 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AlcamQ61490 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AlcamQ61490 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AlcamQ61490 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AlcamQ61490 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
AlcamQ61490 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AlcamQ61490 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AlcamQ61490 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AlcamQ61490 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AlcamQ61490 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AlcamQ61490 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AlcamQ61490 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AlcamQ61490 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AlcamQ61490 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AlcamQ61490 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AlcamQ61490 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AlcamQ61490 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AlcamQ61490 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AlcamQ61490 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AlcamQ61490 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AlcamQ61490 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AlcamQ61490 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AlcamQ61490 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AlcamQ61490 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AlcamQ61490 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AlcamQ61490 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AlcamQ61490 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AlcamQ61490 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AlcamQ61490 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AlcamQ61490 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AlcamQ61490 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AlcamQ61490 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AlcamQ61490 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AlcamQ61490 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AlcamQ61490 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AlcamQ61490 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AlcamQ61490 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AlcamQ61490 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AlcamQ61490 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AlcamQ61490 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
AlcamQ61490 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AlcamQ61490 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AlcamQ61490 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AlcamQ61490 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AlcamQ61490 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AlcamQ61490 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AlcamQ61490 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AlcamQ61490 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AlcamQ61490 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AlcamQ61490 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AlcamQ61490 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AlcamQ61490 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AlcamQ61490 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
AlcamQ61490 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AlcamQ61490 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AlcamQ61490 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AlcamQ61490 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AlcamQ61490 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AlcamQ61490 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AlcamQ61490 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AlcamQ61490 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AlcamQ61490 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AlcamQ61490 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AlcamQ61490 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
AlcamQ61490 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AlcamQ61490 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AlcamQ61490 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AlcamQ61490 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AlcamQ61490 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AlcamQ61490 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AlcamQ61490 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AlcamQ61490 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AlcamQ61490 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AlcamQ61490 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AlcamQ61490 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AlcamQ61490 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms