Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccne1Q61457 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccne1Q61457 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccne1Q61457 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccne1Q61457 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccne1Q61457 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccne1Q61457 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccne1Q61457 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccne1Q61457 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccne1Q61457 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccne1Q61457 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccne1Q61457 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccne1Q61457 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccne1Q61457 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccne1Q61457 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccne1Q61457 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccne1Q61457 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccne1Q61457 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccne1Q61457 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccne1Q61457 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccne1Q61457 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccne1Q61457 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccne1Q61457 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccne1Q61457 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccne1Q61457 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccne1Q61457 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccne1Q61457 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccne1Q61457 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccne1Q61457 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccne1Q61457 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccne1Q61457 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccne1Q61457 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccne1Q61457 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccne1Q61457 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccne1Q61457 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccne1Q61457 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccne1Q61457 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccne1Q61457 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccne1Q61457 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccne1Q61457 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Ccne1Q61457 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccne1Q61457 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccne1Q61457 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccne1Q61457 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccne1Q61457 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccne1Q61457 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccne1Q61457 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccne1Q61457 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccne1Q61457 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccne1Q61457 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccne1Q61457 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccne1Q61457 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccne1Q61457 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccne1Q61457 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccne1Q61457 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccne1Q61457 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccne1Q61457 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccne1Q61457 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccne1Q61457 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccne1Q61457 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccne1Q61457 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccne1Q61457 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccne1Q61457 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccne1Q61457 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccne1Q61457 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccne1Q61457 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ccne1Q61457 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Ccne1Q61457 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ccne1Q61457 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccne1Q61457 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccne1Q61457 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccne1Q61457 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccne1Q61457 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccne1Q61457 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccne1Q61457 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccne1Q61457 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccne1Q61457 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccne1Q61457 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccne1Q61457 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccne1Q61457 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccne1Q61457 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccne1Q61457 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccne1Q61457 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccne1Q61457 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccne1Q61457 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccne1Q61457 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccne1Q61457 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccne1Q61457 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccne1Q61457 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccne1Q61457 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccne1Q61457 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccne1Q61457 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccne1Q61457 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccne1Q61457 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccne1Q61457 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ccne1Q61457 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ccne1Q61457 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccne1Q61457 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccne1Q61457 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccne1Q61457 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms