Protein–RNA interactions for Protein: Q61456

Ccna1, Cyclin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccna1Q61456 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccna1Q61456 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccna1Q61456 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccna1Q61456 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccna1Q61456 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccna1Q61456 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccna1Q61456 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccna1Q61456 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccna1Q61456 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccna1Q61456 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccna1Q61456 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccna1Q61456 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccna1Q61456 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccna1Q61456 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccna1Q61456 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccna1Q61456 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccna1Q61456 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccna1Q61456 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccna1Q61456 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccna1Q61456 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccna1Q61456 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccna1Q61456 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccna1Q61456 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccna1Q61456 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccna1Q61456 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccna1Q61456 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccna1Q61456 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ccna1Q61456 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccna1Q61456 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccna1Q61456 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccna1Q61456 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccna1Q61456 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccna1Q61456 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccna1Q61456 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccna1Q61456 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccna1Q61456 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccna1Q61456 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccna1Q61456 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccna1Q61456 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccna1Q61456 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccna1Q61456 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccna1Q61456 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccna1Q61456 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccna1Q61456 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccna1Q61456 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccna1Q61456 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccna1Q61456 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccna1Q61456 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccna1Q61456 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccna1Q61456 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ccna1Q61456 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ccna1Q61456 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccna1Q61456 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccna1Q61456 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccna1Q61456 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccna1Q61456 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccna1Q61456 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccna1Q61456 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccna1Q61456 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccna1Q61456 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccna1Q61456 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccna1Q61456 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccna1Q61456 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccna1Q61456 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccna1Q61456 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccna1Q61456 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccna1Q61456 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccna1Q61456 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccna1Q61456 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccna1Q61456 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccna1Q61456 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccna1Q61456 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccna1Q61456 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccna1Q61456 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccna1Q61456 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccna1Q61456 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccna1Q61456 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccna1Q61456 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccna1Q61456 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccna1Q61456 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccna1Q61456 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccna1Q61456 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccna1Q61456 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccna1Q61456 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccna1Q61456 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccna1Q61456 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccna1Q61456 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccna1Q61456 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccna1Q61456 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccna1Q61456 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccna1Q61456 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccna1Q61456 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccna1Q61456 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccna1Q61456 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccna1Q61456 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccna1Q61456 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccna1Q61456 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccna1Q61456 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccna1Q61456 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccna1Q61456 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms