Protein–RNA interactions for Protein: Q61301

Ctnna2, Catenin alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna2Q61301 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ctnna2Q61301 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctnna2Q61301 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctnna2Q61301 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctnna2Q61301 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctnna2Q61301 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctnna2Q61301 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctnna2Q61301 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctnna2Q61301 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctnna2Q61301 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctnna2Q61301 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctnna2Q61301 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctnna2Q61301 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctnna2Q61301 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctnna2Q61301 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctnna2Q61301 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctnna2Q61301 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctnna2Q61301 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctnna2Q61301 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctnna2Q61301 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctnna2Q61301 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctnna2Q61301 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctnna2Q61301 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctnna2Q61301 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctnna2Q61301 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctnna2Q61301 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctnna2Q61301 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctnna2Q61301 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctnna2Q61301 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctnna2Q61301 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctnna2Q61301 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctnna2Q61301 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctnna2Q61301 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctnna2Q61301 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctnna2Q61301 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctnna2Q61301 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ctnna2Q61301 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Ctnna2Q61301 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ctnna2Q61301 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ctnna2Q61301 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ctnna2Q61301 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ctnna2Q61301 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctnna2Q61301 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctnna2Q61301 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctnna2Q61301 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctnna2Q61301 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctnna2Q61301 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctnna2Q61301 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctnna2Q61301 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctnna2Q61301 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctnna2Q61301 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctnna2Q61301 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctnna2Q61301 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctnna2Q61301 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctnna2Q61301 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctnna2Q61301 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctnna2Q61301 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctnna2Q61301 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctnna2Q61301 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctnna2Q61301 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctnna2Q61301 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctnna2Q61301 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctnna2Q61301 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctnna2Q61301 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctnna2Q61301 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctnna2Q61301 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctnna2Q61301 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctnna2Q61301 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctnna2Q61301 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctnna2Q61301 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctnna2Q61301 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctnna2Q61301 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctnna2Q61301 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctnna2Q61301 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctnna2Q61301 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctnna2Q61301 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctnna2Q61301 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctnna2Q61301 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ctnna2Q61301 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ctnna2Q61301 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ctnna2Q61301 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ctnna2Q61301 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctnna2Q61301 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctnna2Q61301 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctnna2Q61301 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctnna2Q61301 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctnna2Q61301 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctnna2Q61301 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctnna2Q61301 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctnna2Q61301 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctnna2Q61301 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctnna2Q61301 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctnna2Q61301 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctnna2Q61301 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctnna2Q61301 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctnna2Q61301 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctnna2Q61301 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctnna2Q61301 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctnna2Q61301 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctnna2Q61301 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.1 ms