Protein–RNA interactions for Protein: Q61221

Hif1a, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hif1aQ61221 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Hif1aQ61221 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hif1aQ61221 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hif1aQ61221 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hif1aQ61221 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hif1aQ61221 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hif1aQ61221 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hif1aQ61221 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hif1aQ61221 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hif1aQ61221 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hif1aQ61221 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hif1aQ61221 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hif1aQ61221 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hif1aQ61221 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hif1aQ61221 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Hif1aQ61221 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hif1aQ61221 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hif1aQ61221 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hif1aQ61221 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hif1aQ61221 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hif1aQ61221 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hif1aQ61221 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Hif1aQ61221 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hif1aQ61221 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Hif1aQ61221 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hif1aQ61221 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hif1aQ61221 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hif1aQ61221 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hif1aQ61221 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hif1aQ61221 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hif1aQ61221 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hif1aQ61221 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hif1aQ61221 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hif1aQ61221 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hif1aQ61221 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hif1aQ61221 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hif1aQ61221 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hif1aQ61221 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hif1aQ61221 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hif1aQ61221 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hif1aQ61221 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hif1aQ61221 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hif1aQ61221 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hif1aQ61221 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hif1aQ61221 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hif1aQ61221 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hif1aQ61221 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hif1aQ61221 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hif1aQ61221 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hif1aQ61221 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hif1aQ61221 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hif1aQ61221 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hif1aQ61221 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hif1aQ61221 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hif1aQ61221 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hif1aQ61221 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Hif1aQ61221 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hif1aQ61221 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hif1aQ61221 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hif1aQ61221 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hif1aQ61221 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hif1aQ61221 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hif1aQ61221 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hif1aQ61221 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hif1aQ61221 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hif1aQ61221 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hif1aQ61221 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hif1aQ61221 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hif1aQ61221 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hif1aQ61221 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hif1aQ61221 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hif1aQ61221 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hif1aQ61221 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hif1aQ61221 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hif1aQ61221 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hif1aQ61221 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hif1aQ61221 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hif1aQ61221 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Hif1aQ61221 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hif1aQ61221 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hif1aQ61221 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hif1aQ61221 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hif1aQ61221 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hif1aQ61221 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hif1aQ61221 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hif1aQ61221 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hif1aQ61221 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hif1aQ61221 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hif1aQ61221 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Hif1aQ61221 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hif1aQ61221 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hif1aQ61221 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Hif1aQ61221 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hif1aQ61221 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hif1aQ61221 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hif1aQ61221 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hif1aQ61221 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hif1aQ61221 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hif1aQ61221 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hif1aQ61221 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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