Protein–RNA interactions for Protein: Q61143

Trpc6, Short transient receptor potential channel 6, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc6Q61143 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpc6Q61143 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpc6Q61143 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpc6Q61143 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpc6Q61143 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpc6Q61143 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpc6Q61143 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpc6Q61143 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trpc6Q61143 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trpc6Q61143 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trpc6Q61143 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trpc6Q61143 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trpc6Q61143 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trpc6Q61143 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trpc6Q61143 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trpc6Q61143 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Trpc6Q61143 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trpc6Q61143 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trpc6Q61143 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trpc6Q61143 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trpc6Q61143 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trpc6Q61143 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trpc6Q61143 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trpc6Q61143 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trpc6Q61143 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trpc6Q61143 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trpc6Q61143 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trpc6Q61143 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trpc6Q61143 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trpc6Q61143 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trpc6Q61143 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trpc6Q61143 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trpc6Q61143 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trpc6Q61143 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trpc6Q61143 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trpc6Q61143 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trpc6Q61143 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trpc6Q61143 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trpc6Q61143 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trpc6Q61143 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trpc6Q61143 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trpc6Q61143 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trpc6Q61143 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trpc6Q61143 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Trpc6Q61143 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Trpc6Q61143 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Trpc6Q61143 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trpc6Q61143 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trpc6Q61143 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trpc6Q61143 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trpc6Q61143 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trpc6Q61143 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trpc6Q61143 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trpc6Q61143 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Trpc6Q61143 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trpc6Q61143 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trpc6Q61143 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trpc6Q61143 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trpc6Q61143 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trpc6Q61143 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trpc6Q61143 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trpc6Q61143 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trpc6Q61143 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trpc6Q61143 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trpc6Q61143 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trpc6Q61143 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trpc6Q61143 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trpc6Q61143 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trpc6Q61143 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trpc6Q61143 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trpc6Q61143 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Trpc6Q61143 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Trpc6Q61143 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trpc6Q61143 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trpc6Q61143 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trpc6Q61143 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Trpc6Q61143 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trpc6Q61143 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trpc6Q61143 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trpc6Q61143 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trpc6Q61143 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trpc6Q61143 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trpc6Q61143 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trpc6Q61143 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Trpc6Q61143 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trpc6Q61143 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trpc6Q61143 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trpc6Q61143 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trpc6Q61143 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trpc6Q61143 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Trpc6Q61143 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trpc6Q61143 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trpc6Q61143 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trpc6Q61143 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trpc6Q61143 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trpc6Q61143 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trpc6Q61143 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trpc6Q61143 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trpc6Q61143 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trpc6Q61143 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms