Protein–RNA interactions for Protein: Q61025

Ift20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift20Q61025 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ift20Q61025 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ift20Q61025 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ift20Q61025 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ift20Q61025 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ift20Q61025 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ift20Q61025 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ift20Q61025 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ift20Q61025 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ift20Q61025 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ift20Q61025 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ift20Q61025 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ift20Q61025 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ift20Q61025 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ift20Q61025 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ift20Q61025 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ift20Q61025 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ift20Q61025 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ift20Q61025 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ift20Q61025 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ift20Q61025 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ift20Q61025 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ift20Q61025 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ift20Q61025 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ift20Q61025 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ift20Q61025 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ift20Q61025 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ift20Q61025 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ift20Q61025 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ift20Q61025 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ift20Q61025 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ift20Q61025 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ift20Q61025 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ift20Q61025 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ift20Q61025 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ift20Q61025 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ift20Q61025 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ift20Q61025 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ift20Q61025 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ift20Q61025 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ift20Q61025 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ift20Q61025 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ift20Q61025 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ift20Q61025 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ift20Q61025 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ift20Q61025 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ift20Q61025 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ift20Q61025 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ift20Q61025 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ift20Q61025 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ift20Q61025 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ift20Q61025 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ift20Q61025 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ift20Q61025 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ift20Q61025 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ift20Q61025 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ift20Q61025 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ift20Q61025 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ift20Q61025 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ift20Q61025 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ift20Q61025 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ift20Q61025 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ift20Q61025 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ift20Q61025 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ift20Q61025 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ift20Q61025 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ift20Q61025 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ift20Q61025 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ift20Q61025 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ift20Q61025 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ift20Q61025 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ift20Q61025 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ift20Q61025 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ift20Q61025 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ift20Q61025 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ift20Q61025 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ift20Q61025 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ift20Q61025 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ift20Q61025 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ift20Q61025 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ift20Q61025 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ift20Q61025 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ift20Q61025 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ift20Q61025 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ift20Q61025 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ift20Q61025 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ift20Q61025 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ift20Q61025 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ift20Q61025 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ift20Q61025 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ift20Q61025 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ift20Q61025 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ift20Q61025 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ift20Q61025 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ift20Q61025 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ift20Q61025 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ift20Q61025 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ift20Q61025 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ift20Q61025 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ift20Q61025 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms