Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PtprnQ60673 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtprnQ60673 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtprnQ60673 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtprnQ60673 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtprnQ60673 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PtprnQ60673 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PtprnQ60673 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PtprnQ60673 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtprnQ60673 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PtprnQ60673 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PtprnQ60673 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtprnQ60673 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtprnQ60673 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PtprnQ60673 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtprnQ60673 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PtprnQ60673 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtprnQ60673 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PtprnQ60673 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtprnQ60673 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtprnQ60673 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtprnQ60673 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtprnQ60673 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtprnQ60673 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtprnQ60673 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtprnQ60673 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtprnQ60673 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PtprnQ60673 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PtprnQ60673 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PtprnQ60673 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PtprnQ60673 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PtprnQ60673 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtprnQ60673 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtprnQ60673 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtprnQ60673 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtprnQ60673 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtprnQ60673 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtprnQ60673 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtprnQ60673 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtprnQ60673 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtprnQ60673 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtprnQ60673 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtprnQ60673 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtprnQ60673 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtprnQ60673 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtprnQ60673 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtprnQ60673 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtprnQ60673 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtprnQ60673 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtprnQ60673 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtprnQ60673 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtprnQ60673 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtprnQ60673 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtprnQ60673 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtprnQ60673 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtprnQ60673 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtprnQ60673 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtprnQ60673 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtprnQ60673 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtprnQ60673 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtprnQ60673 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtprnQ60673 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtprnQ60673 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtprnQ60673 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtprnQ60673 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtprnQ60673 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtprnQ60673 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtprnQ60673 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtprnQ60673 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtprnQ60673 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtprnQ60673 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtprnQ60673 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprnQ60673 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprnQ60673 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprnQ60673 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprnQ60673 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprnQ60673 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprnQ60673 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprnQ60673 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprnQ60673 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprnQ60673 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprnQ60673 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprnQ60673 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprnQ60673 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprnQ60673 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprnQ60673 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprnQ60673 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprnQ60673 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprnQ60673 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprnQ60673 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprnQ60673 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtprnQ60673 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtprnQ60673 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PtprnQ60673 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtprnQ60673 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtprnQ60673 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtprnQ60673 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtprnQ60673 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtprnQ60673 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtprnQ60673 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.4 ms