Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vmn1r196Q5SVD5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vmn1r196Q5SVD5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vmn1r196Q5SVD5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vmn1r196Q5SVD5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vmn1r196Q5SVD5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Vmn1r196Q5SVD5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vmn1r196Q5SVD5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vmn1r196Q5SVD5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vmn1r196Q5SVD5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vmn1r196Q5SVD5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vmn1r196Q5SVD5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vmn1r196Q5SVD5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vmn1r196Q5SVD5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vmn1r196Q5SVD5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vmn1r196Q5SVD5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vmn1r196Q5SVD5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vmn1r196Q5SVD5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vmn1r196Q5SVD5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vmn1r196Q5SVD5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vmn1r196Q5SVD5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vmn1r196Q5SVD5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Vmn1r196Q5SVD5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vmn1r196Q5SVD5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vmn1r196Q5SVD5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vmn1r196Q5SVD5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vmn1r196Q5SVD5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vmn1r196Q5SVD5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vmn1r196Q5SVD5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vmn1r196Q5SVD5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vmn1r196Q5SVD5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vmn1r196Q5SVD5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vmn1r196Q5SVD5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vmn1r196Q5SVD5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vmn1r196Q5SVD5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vmn1r196Q5SVD5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vmn1r196Q5SVD5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vmn1r196Q5SVD5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Vmn1r196Q5SVD5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Vmn1r196Q5SVD5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vmn1r196Q5SVD5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vmn1r196Q5SVD5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vmn1r196Q5SVD5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vmn1r196Q5SVD5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vmn1r196Q5SVD5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vmn1r196Q5SVD5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vmn1r196Q5SVD5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vmn1r196Q5SVD5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vmn1r196Q5SVD5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vmn1r196Q5SVD5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vmn1r196Q5SVD5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vmn1r196Q5SVD5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vmn1r196Q5SVD5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vmn1r196Q5SVD5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Vmn1r196Q5SVD5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vmn1r196Q5SVD5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Vmn1r196Q5SVD5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vmn1r196Q5SVD5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Vmn1r196Q5SVD5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vmn1r196Q5SVD5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vmn1r196Q5SVD5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vmn1r196Q5SVD5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vmn1r196Q5SVD5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vmn1r196Q5SVD5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vmn1r196Q5SVD5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vmn1r196Q5SVD5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vmn1r196Q5SVD5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vmn1r196Q5SVD5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vmn1r196Q5SVD5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vmn1r196Q5SVD5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vmn1r196Q5SVD5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vmn1r196Q5SVD5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vmn1r196Q5SVD5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vmn1r196Q5SVD5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vmn1r196Q5SVD5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vmn1r196Q5SVD5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vmn1r196Q5SVD5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vmn1r196Q5SVD5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vmn1r196Q5SVD5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vmn1r196Q5SVD5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vmn1r196Q5SVD5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vmn1r196Q5SVD5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vmn1r196Q5SVD5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vmn1r196Q5SVD5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vmn1r196Q5SVD5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vmn1r196Q5SVD5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vmn1r196Q5SVD5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vmn1r196Q5SVD5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vmn1r196Q5SVD5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vmn1r196Q5SVD5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vmn1r196Q5SVD5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vmn1r196Q5SVD5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vmn1r196Q5SVD5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vmn1r196Q5SVD5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vmn1r196Q5SVD5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vmn1r196Q5SVD5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vmn1r196Q5SVD5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 166 ms