Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1C3

Trav3-3, T cell receptor alpha variable 3-3 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav3-3Q5R1C3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trav3-3Q5R1C3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trav3-3Q5R1C3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trav3-3Q5R1C3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trav3-3Q5R1C3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trav3-3Q5R1C3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Trav3-3Q5R1C3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trav3-3Q5R1C3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trav3-3Q5R1C3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trav3-3Q5R1C3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trav3-3Q5R1C3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trav3-3Q5R1C3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav3-3Q5R1C3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav3-3Q5R1C3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav3-3Q5R1C3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav3-3Q5R1C3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav3-3Q5R1C3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav3-3Q5R1C3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav3-3Q5R1C3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav3-3Q5R1C3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav3-3Q5R1C3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav3-3Q5R1C3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav3-3Q5R1C3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav3-3Q5R1C3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav3-3Q5R1C3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav3-3Q5R1C3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav3-3Q5R1C3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav3-3Q5R1C3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav3-3Q5R1C3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav3-3Q5R1C3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav3-3Q5R1C3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav3-3Q5R1C3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav3-3Q5R1C3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav3-3Q5R1C3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav3-3Q5R1C3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav3-3Q5R1C3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav3-3Q5R1C3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav3-3Q5R1C3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav3-3Q5R1C3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav3-3Q5R1C3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trav3-3Q5R1C3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trav3-3Q5R1C3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trav3-3Q5R1C3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trav3-3Q5R1C3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trav3-3Q5R1C3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trav3-3Q5R1C3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trav3-3Q5R1C3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trav3-3Q5R1C3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trav3-3Q5R1C3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trav3-3Q5R1C3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trav3-3Q5R1C3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trav3-3Q5R1C3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trav3-3Q5R1C3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Trav3-3Q5R1C3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trav3-3Q5R1C3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trav3-3Q5R1C3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trav3-3Q5R1C3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trav3-3Q5R1C3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav3-3Q5R1C3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav3-3Q5R1C3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav3-3Q5R1C3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav3-3Q5R1C3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav3-3Q5R1C3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav3-3Q5R1C3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav3-3Q5R1C3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav3-3Q5R1C3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav3-3Q5R1C3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav3-3Q5R1C3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav3-3Q5R1C3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav3-3Q5R1C3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav3-3Q5R1C3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav3-3Q5R1C3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav3-3Q5R1C3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav3-3Q5R1C3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trav3-3Q5R1C3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trav3-3Q5R1C3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trav3-3Q5R1C3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trav3-3Q5R1C3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trav3-3Q5R1C3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trav3-3Q5R1C3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trav3-3Q5R1C3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trav3-3Q5R1C3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trav3-3Q5R1C3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trav3-3Q5R1C3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trav3-3Q5R1C3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trav3-3Q5R1C3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav3-3Q5R1C3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav3-3Q5R1C3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav3-3Q5R1C3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav3-3Q5R1C3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav3-3Q5R1C3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav3-3Q5R1C3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav3-3Q5R1C3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav3-3Q5R1C3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav3-3Q5R1C3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav3-3Q5R1C3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav3-3Q5R1C3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav3-3Q5R1C3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trav3-3Q5R1C3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trav3-3Q5R1C3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms