Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trdv4Q5R1A3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trdv4Q5R1A3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Trdv4Q5R1A3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trdv4Q5R1A3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trdv4Q5R1A3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trdv4Q5R1A3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trdv4Q5R1A3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trdv4Q5R1A3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trdv4Q5R1A3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trdv4Q5R1A3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trdv4Q5R1A3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trdv4Q5R1A3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trdv4Q5R1A3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trdv4Q5R1A3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trdv4Q5R1A3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trdv4Q5R1A3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trdv4Q5R1A3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trdv4Q5R1A3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trdv4Q5R1A3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trdv4Q5R1A3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trdv4Q5R1A3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trdv4Q5R1A3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trdv4Q5R1A3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trdv4Q5R1A3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trdv4Q5R1A3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Trdv4Q5R1A3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trdv4Q5R1A3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trdv4Q5R1A3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trdv4Q5R1A3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trdv4Q5R1A3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trdv4Q5R1A3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trdv4Q5R1A3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trdv4Q5R1A3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trdv4Q5R1A3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trdv4Q5R1A3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trdv4Q5R1A3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trdv4Q5R1A3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trdv4Q5R1A3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trdv4Q5R1A3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trdv4Q5R1A3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trdv4Q5R1A3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trdv4Q5R1A3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trdv4Q5R1A3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trdv4Q5R1A3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trdv4Q5R1A3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trdv4Q5R1A3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trdv4Q5R1A3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trdv4Q5R1A3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trdv4Q5R1A3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trdv4Q5R1A3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trdv4Q5R1A3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trdv4Q5R1A3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trdv4Q5R1A3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trdv4Q5R1A3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trdv4Q5R1A3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trdv4Q5R1A3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trdv4Q5R1A3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trdv4Q5R1A3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trdv4Q5R1A3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trdv4Q5R1A3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trdv4Q5R1A3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trdv4Q5R1A3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trdv4Q5R1A3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trdv4Q5R1A3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trdv4Q5R1A3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Trdv4Q5R1A3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Trdv4Q5R1A3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trdv4Q5R1A3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trdv4Q5R1A3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trdv4Q5R1A3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trdv4Q5R1A3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trdv4Q5R1A3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trdv4Q5R1A3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trdv4Q5R1A3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trdv4Q5R1A3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Trdv4Q5R1A3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Trdv4Q5R1A3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Trdv4Q5R1A3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trdv4Q5R1A3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trdv4Q5R1A3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trdv4Q5R1A3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trdv4Q5R1A3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trdv4Q5R1A3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trdv4Q5R1A3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trdv4Q5R1A3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trdv4Q5R1A3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trdv4Q5R1A3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Trdv4Q5R1A3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trdv4Q5R1A3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trdv4Q5R1A3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Trdv4Q5R1A3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trdv4Q5R1A3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trdv4Q5R1A3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trdv4Q5R1A3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trdv4Q5R1A3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trdv4Q5R1A3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trdv4Q5R1A3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trdv4Q5R1A3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trdv4Q5R1A3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms