Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ttf2Q5NC05 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ttf2Q5NC05 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ttf2Q5NC05 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ttf2Q5NC05 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ttf2Q5NC05 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ttf2Q5NC05 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ttf2Q5NC05 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ttf2Q5NC05 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ttf2Q5NC05 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ttf2Q5NC05 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ttf2Q5NC05 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ttf2Q5NC05 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ttf2Q5NC05 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ttf2Q5NC05 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ttf2Q5NC05 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ttf2Q5NC05 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ttf2Q5NC05 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ttf2Q5NC05 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttf2Q5NC05 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttf2Q5NC05 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttf2Q5NC05 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttf2Q5NC05 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttf2Q5NC05 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttf2Q5NC05 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttf2Q5NC05 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ttf2Q5NC05 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ttf2Q5NC05 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ttf2Q5NC05 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ttf2Q5NC05 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttf2Q5NC05 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttf2Q5NC05 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttf2Q5NC05 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttf2Q5NC05 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttf2Q5NC05 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttf2Q5NC05 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttf2Q5NC05 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttf2Q5NC05 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttf2Q5NC05 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttf2Q5NC05 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttf2Q5NC05 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttf2Q5NC05 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttf2Q5NC05 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ttf2Q5NC05 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ttf2Q5NC05 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ttf2Q5NC05 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ttf2Q5NC05 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ttf2Q5NC05 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ttf2Q5NC05 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ttf2Q5NC05 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ttf2Q5NC05 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ttf2Q5NC05 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ttf2Q5NC05 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ttf2Q5NC05 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ttf2Q5NC05 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ttf2Q5NC05 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ttf2Q5NC05 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ttf2Q5NC05 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ttf2Q5NC05 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ttf2Q5NC05 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ttf2Q5NC05 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ttf2Q5NC05 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ttf2Q5NC05 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ttf2Q5NC05 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ttf2Q5NC05 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ttf2Q5NC05 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ttf2Q5NC05 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ttf2Q5NC05 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ttf2Q5NC05 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttf2Q5NC05 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttf2Q5NC05 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttf2Q5NC05 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttf2Q5NC05 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttf2Q5NC05 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttf2Q5NC05 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttf2Q5NC05 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttf2Q5NC05 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttf2Q5NC05 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttf2Q5NC05 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttf2Q5NC05 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ttf2Q5NC05 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ttf2Q5NC05 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ttf2Q5NC05 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ttf2Q5NC05 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ttf2Q5NC05 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ttf2Q5NC05 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ttf2Q5NC05 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ttf2Q5NC05 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ttf2Q5NC05 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ttf2Q5NC05 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ttf2Q5NC05 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttf2Q5NC05 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttf2Q5NC05 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttf2Q5NC05 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttf2Q5NC05 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttf2Q5NC05 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttf2Q5NC05 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttf2Q5NC05 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ttf2Q5NC05 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ttf2Q5NC05 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms