Protein–RNA interactions for Protein: Q5GIG6

Tnni3k, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3kQ5GIG6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnni3kQ5GIG6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnni3kQ5GIG6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnni3kQ5GIG6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnni3kQ5GIG6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnni3kQ5GIG6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnni3kQ5GIG6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnni3kQ5GIG6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnni3kQ5GIG6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnni3kQ5GIG6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnni3kQ5GIG6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tnni3kQ5GIG6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tnni3kQ5GIG6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tnni3kQ5GIG6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tnni3kQ5GIG6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tnni3kQ5GIG6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnni3kQ5GIG6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnni3kQ5GIG6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnni3kQ5GIG6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnni3kQ5GIG6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnni3kQ5GIG6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnni3kQ5GIG6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnni3kQ5GIG6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnni3kQ5GIG6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnni3kQ5GIG6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnni3kQ5GIG6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnni3kQ5GIG6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnni3kQ5GIG6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnni3kQ5GIG6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnni3kQ5GIG6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnni3kQ5GIG6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnni3kQ5GIG6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnni3kQ5GIG6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnni3kQ5GIG6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnni3kQ5GIG6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnni3kQ5GIG6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnni3kQ5GIG6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnni3kQ5GIG6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnni3kQ5GIG6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnni3kQ5GIG6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnni3kQ5GIG6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnni3kQ5GIG6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnni3kQ5GIG6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnni3kQ5GIG6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnni3kQ5GIG6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnni3kQ5GIG6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnni3kQ5GIG6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnni3kQ5GIG6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnni3kQ5GIG6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnni3kQ5GIG6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnni3kQ5GIG6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnni3kQ5GIG6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnni3kQ5GIG6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnni3kQ5GIG6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnni3kQ5GIG6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnni3kQ5GIG6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnni3kQ5GIG6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnni3kQ5GIG6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnni3kQ5GIG6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnni3kQ5GIG6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnni3kQ5GIG6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnni3kQ5GIG6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnni3kQ5GIG6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnni3kQ5GIG6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnni3kQ5GIG6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnni3kQ5GIG6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnni3kQ5GIG6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnni3kQ5GIG6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnni3kQ5GIG6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnni3kQ5GIG6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnni3kQ5GIG6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnni3kQ5GIG6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnni3kQ5GIG6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnni3kQ5GIG6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnni3kQ5GIG6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnni3kQ5GIG6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnni3kQ5GIG6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnni3kQ5GIG6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnni3kQ5GIG6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tnni3kQ5GIG6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnni3kQ5GIG6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnni3kQ5GIG6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnni3kQ5GIG6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnni3kQ5GIG6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnni3kQ5GIG6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnni3kQ5GIG6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnni3kQ5GIG6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnni3kQ5GIG6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnni3kQ5GIG6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnni3kQ5GIG6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnni3kQ5GIG6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnni3kQ5GIG6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnni3kQ5GIG6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnni3kQ5GIG6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnni3kQ5GIG6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnni3kQ5GIG6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnni3kQ5GIG6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnni3kQ5GIG6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnni3kQ5GIG6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnni3kQ5GIG6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms