Protein–RNA interactions for Protein: Q56A06

Tmtc2, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmtc2Q56A06 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmtc2Q56A06 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmtc2Q56A06 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmtc2Q56A06 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tmtc2Q56A06 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tmtc2Q56A06 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tmtc2Q56A06 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tmtc2Q56A06 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Tmtc2Q56A06 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tmtc2Q56A06 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmtc2Q56A06 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmtc2Q56A06 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmtc2Q56A06 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmtc2Q56A06 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmtc2Q56A06 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmtc2Q56A06 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmtc2Q56A06 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tmtc2Q56A06 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tmtc2Q56A06 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tmtc2Q56A06 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Tmtc2Q56A06 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tmtc2Q56A06 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tmtc2Q56A06 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tmtc2Q56A06 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tmtc2Q56A06 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Tmtc2Q56A06 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tmtc2Q56A06 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tmtc2Q56A06 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmtc2Q56A06 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmtc2Q56A06 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tmtc2Q56A06 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tmtc2Q56A06 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tmtc2Q56A06 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tmtc2Q56A06 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tmtc2Q56A06 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tmtc2Q56A06 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tmtc2Q56A06 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmtc2Q56A06 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmtc2Q56A06 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmtc2Q56A06 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmtc2Q56A06 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmtc2Q56A06 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmtc2Q56A06 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmtc2Q56A06 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmtc2Q56A06 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmtc2Q56A06 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmtc2Q56A06 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tmtc2Q56A06 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tmtc2Q56A06 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tmtc2Q56A06 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tmtc2Q56A06 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tmtc2Q56A06 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Tmtc2Q56A06 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tmtc2Q56A06 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmtc2Q56A06 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmtc2Q56A06 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmtc2Q56A06 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmtc2Q56A06 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmtc2Q56A06 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmtc2Q56A06 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmtc2Q56A06 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmtc2Q56A06 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmtc2Q56A06 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmtc2Q56A06 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmtc2Q56A06 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmtc2Q56A06 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmtc2Q56A06 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmtc2Q56A06 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmtc2Q56A06 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmtc2Q56A06 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmtc2Q56A06 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmtc2Q56A06 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmtc2Q56A06 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmtc2Q56A06 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmtc2Q56A06 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmtc2Q56A06 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmtc2Q56A06 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tmtc2Q56A06 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tmtc2Q56A06 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tmtc2Q56A06 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tmtc2Q56A06 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tmtc2Q56A06 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tmtc2Q56A06 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tmtc2Q56A06 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tmtc2Q56A06 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tmtc2Q56A06 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tmtc2Q56A06 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tmtc2Q56A06 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tmtc2Q56A06 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tmtc2Q56A06 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tmtc2Q56A06 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tmtc2Q56A06 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tmtc2Q56A06 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tmtc2Q56A06 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tmtc2Q56A06 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tmtc2Q56A06 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tmtc2Q56A06 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmtc2Q56A06 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmtc2Q56A06 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmtc2Q56A06 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms