Protein–RNA interactions for Protein: Q569L8

Cenpj, Centromere protein J, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpjQ569L8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CenpjQ569L8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CenpjQ569L8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CenpjQ569L8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CenpjQ569L8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CenpjQ569L8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
CenpjQ569L8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CenpjQ569L8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CenpjQ569L8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CenpjQ569L8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CenpjQ569L8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CenpjQ569L8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CenpjQ569L8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CenpjQ569L8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CenpjQ569L8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CenpjQ569L8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CenpjQ569L8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CenpjQ569L8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CenpjQ569L8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CenpjQ569L8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CenpjQ569L8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CenpjQ569L8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CenpjQ569L8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CenpjQ569L8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CenpjQ569L8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CenpjQ569L8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CenpjQ569L8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CenpjQ569L8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CenpjQ569L8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CenpjQ569L8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CenpjQ569L8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CenpjQ569L8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CenpjQ569L8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CenpjQ569L8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CenpjQ569L8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CenpjQ569L8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CenpjQ569L8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CenpjQ569L8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CenpjQ569L8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CenpjQ569L8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CenpjQ569L8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CenpjQ569L8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CenpjQ569L8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CenpjQ569L8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CenpjQ569L8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CenpjQ569L8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CenpjQ569L8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CenpjQ569L8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CenpjQ569L8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CenpjQ569L8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CenpjQ569L8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CenpjQ569L8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CenpjQ569L8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CenpjQ569L8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CenpjQ569L8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CenpjQ569L8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CenpjQ569L8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CenpjQ569L8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CenpjQ569L8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CenpjQ569L8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CenpjQ569L8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CenpjQ569L8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CenpjQ569L8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CenpjQ569L8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CenpjQ569L8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CenpjQ569L8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CenpjQ569L8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CenpjQ569L8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CenpjQ569L8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CenpjQ569L8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CenpjQ569L8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CenpjQ569L8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CenpjQ569L8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CenpjQ569L8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CenpjQ569L8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CenpjQ569L8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CenpjQ569L8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CenpjQ569L8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.29
CenpjQ569L8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CenpjQ569L8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CenpjQ569L8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CenpjQ569L8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CenpjQ569L8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CenpjQ569L8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CenpjQ569L8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CenpjQ569L8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CenpjQ569L8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CenpjQ569L8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CenpjQ569L8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CenpjQ569L8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CenpjQ569L8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CenpjQ569L8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CenpjQ569L8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CenpjQ569L8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CenpjQ569L8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CenpjQ569L8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CenpjQ569L8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CenpjQ569L8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CenpjQ569L8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CenpjQ569L8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms