Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA36

Ccdc84, Coiled-coil domain-containing protein 84, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc84Q4VA36 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc84Q4VA36 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc84Q4VA36 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc84Q4VA36 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc84Q4VA36 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc84Q4VA36 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc84Q4VA36 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc84Q4VA36 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc84Q4VA36 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc84Q4VA36 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc84Q4VA36 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc84Q4VA36 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc84Q4VA36 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc84Q4VA36 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc84Q4VA36 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc84Q4VA36 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc84Q4VA36 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc84Q4VA36 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc84Q4VA36 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc84Q4VA36 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc84Q4VA36 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc84Q4VA36 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc84Q4VA36 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc84Q4VA36 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc84Q4VA36 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc84Q4VA36 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc84Q4VA36 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc84Q4VA36 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc84Q4VA36 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc84Q4VA36 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccdc84Q4VA36 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc84Q4VA36 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc84Q4VA36 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc84Q4VA36 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc84Q4VA36 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc84Q4VA36 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc84Q4VA36 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc84Q4VA36 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc84Q4VA36 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc84Q4VA36 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc84Q4VA36 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc84Q4VA36 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc84Q4VA36 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc84Q4VA36 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc84Q4VA36 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc84Q4VA36 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc84Q4VA36 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc84Q4VA36 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc84Q4VA36 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc84Q4VA36 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc84Q4VA36 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc84Q4VA36 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc84Q4VA36 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc84Q4VA36 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc84Q4VA36 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc84Q4VA36 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc84Q4VA36 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc84Q4VA36 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc84Q4VA36 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc84Q4VA36 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc84Q4VA36 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc84Q4VA36 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc84Q4VA36 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc84Q4VA36 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc84Q4VA36 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc84Q4VA36 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc84Q4VA36 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc84Q4VA36 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc84Q4VA36 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc84Q4VA36 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc84Q4VA36 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc84Q4VA36 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc84Q4VA36 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc84Q4VA36 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc84Q4VA36 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc84Q4VA36 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc84Q4VA36 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc84Q4VA36 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc84Q4VA36 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc84Q4VA36 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc84Q4VA36 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc84Q4VA36 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc84Q4VA36 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc84Q4VA36 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc84Q4VA36 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc84Q4VA36 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc84Q4VA36 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc84Q4VA36 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc84Q4VA36 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc84Q4VA36 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc84Q4VA36 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc84Q4VA36 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc84Q4VA36 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc84Q4VA36 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc84Q4VA36 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc84Q4VA36 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc84Q4VA36 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc84Q4VA36 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc84Q4VA36 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc84Q4VA36 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms