Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDF6

Cfhr2, Complement factor H-related 2, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfhr2Q4LDF6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cfhr2Q4LDF6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cfhr2Q4LDF6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cfhr2Q4LDF6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cfhr2Q4LDF6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cfhr2Q4LDF6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cfhr2Q4LDF6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cfhr2Q4LDF6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cfhr2Q4LDF6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cfhr2Q4LDF6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cfhr2Q4LDF6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cfhr2Q4LDF6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cfhr2Q4LDF6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cfhr2Q4LDF6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cfhr2Q4LDF6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cfhr2Q4LDF6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cfhr2Q4LDF6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cfhr2Q4LDF6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cfhr2Q4LDF6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cfhr2Q4LDF6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cfhr2Q4LDF6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cfhr2Q4LDF6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cfhr2Q4LDF6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cfhr2Q4LDF6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cfhr2Q4LDF6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cfhr2Q4LDF6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cfhr2Q4LDF6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cfhr2Q4LDF6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cfhr2Q4LDF6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cfhr2Q4LDF6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cfhr2Q4LDF6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cfhr2Q4LDF6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cfhr2Q4LDF6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cfhr2Q4LDF6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cfhr2Q4LDF6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cfhr2Q4LDF6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cfhr2Q4LDF6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cfhr2Q4LDF6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cfhr2Q4LDF6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cfhr2Q4LDF6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cfhr2Q4LDF6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cfhr2Q4LDF6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cfhr2Q4LDF6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cfhr2Q4LDF6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cfhr2Q4LDF6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cfhr2Q4LDF6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cfhr2Q4LDF6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cfhr2Q4LDF6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cfhr2Q4LDF6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cfhr2Q4LDF6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cfhr2Q4LDF6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cfhr2Q4LDF6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cfhr2Q4LDF6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cfhr2Q4LDF6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cfhr2Q4LDF6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cfhr2Q4LDF6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cfhr2Q4LDF6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cfhr2Q4LDF6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cfhr2Q4LDF6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cfhr2Q4LDF6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cfhr2Q4LDF6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cfhr2Q4LDF6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cfhr2Q4LDF6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cfhr2Q4LDF6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cfhr2Q4LDF6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cfhr2Q4LDF6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cfhr2Q4LDF6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cfhr2Q4LDF6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cfhr2Q4LDF6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cfhr2Q4LDF6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cfhr2Q4LDF6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cfhr2Q4LDF6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cfhr2Q4LDF6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cfhr2Q4LDF6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cfhr2Q4LDF6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cfhr2Q4LDF6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cfhr2Q4LDF6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cfhr2Q4LDF6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cfhr2Q4LDF6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cfhr2Q4LDF6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cfhr2Q4LDF6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cfhr2Q4LDF6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cfhr2Q4LDF6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cfhr2Q4LDF6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cfhr2Q4LDF6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cfhr2Q4LDF6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cfhr2Q4LDF6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cfhr2Q4LDF6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cfhr2Q4LDF6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cfhr2Q4LDF6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cfhr2Q4LDF6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cfhr2Q4LDF6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cfhr2Q4LDF6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cfhr2Q4LDF6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cfhr2Q4LDF6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cfhr2Q4LDF6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cfhr2Q4LDF6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cfhr2Q4LDF6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cfhr2Q4LDF6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cfhr2Q4LDF6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms