Protein–RNA interactions for Protein: Q499E6

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q499E6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C1orf109Q499E6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C1orf109Q499E6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C1orf109Q499E6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C1orf109Q499E6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C1orf109Q499E6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C1orf109Q499E6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
C1orf109Q499E6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
C1orf109Q499E6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C1orf109Q499E6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C1orf109Q499E6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C1orf109Q499E6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C1orf109Q499E6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C1orf109Q499E6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C1orf109Q499E6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C1orf109Q499E6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C1orf109Q499E6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C1orf109Q499E6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C1orf109Q499E6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C1orf109Q499E6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C1orf109Q499E6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C1orf109Q499E6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C1orf109Q499E6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C1orf109Q499E6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C1orf109Q499E6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C1orf109Q499E6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C1orf109Q499E6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C1orf109Q499E6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C1orf109Q499E6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C1orf109Q499E6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C1orf109Q499E6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C1orf109Q499E6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C1orf109Q499E6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C1orf109Q499E6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
C1orf109Q499E6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C1orf109Q499E6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C1orf109Q499E6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C1orf109Q499E6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C1orf109Q499E6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C1orf109Q499E6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C1orf109Q499E6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C1orf109Q499E6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C1orf109Q499E6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
C1orf109Q499E6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C1orf109Q499E6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C1orf109Q499E6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C1orf109Q499E6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf109Q499E6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf109Q499E6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf109Q499E6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf109Q499E6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf109Q499E6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf109Q499E6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf109Q499E6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf109Q499E6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf109Q499E6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf109Q499E6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf109Q499E6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf109Q499E6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf109Q499E6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf109Q499E6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf109Q499E6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C1orf109Q499E6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C1orf109Q499E6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C1orf109Q499E6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C1orf109Q499E6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C1orf109Q499E6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C1orf109Q499E6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
C1orf109Q499E6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1orf109Q499E6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1orf109Q499E6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1orf109Q499E6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
C1orf109Q499E6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1orf109Q499E6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1orf109Q499E6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1orf109Q499E6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C1orf109Q499E6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
C1orf109Q499E6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C1orf109Q499E6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C1orf109Q499E6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C1orf109Q499E6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
C1orf109Q499E6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C1orf109Q499E6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C1orf109Q499E6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C1orf109Q499E6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C1orf109Q499E6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C1orf109Q499E6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C1orf109Q499E6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C1orf109Q499E6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C1orf109Q499E6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C1orf109Q499E6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C1orf109Q499E6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C1orf109Q499E6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C1orf109Q499E6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C1orf109Q499E6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C1orf109Q499E6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C1orf109Q499E6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C1orf109Q499E6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C1orf109Q499E6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C1orf109Q499E6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms