Protein–RNA interactions for Protein: Q499E0

Brinp3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brinp3Q499E0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Brinp3Q499E0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Brinp3Q499E0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Brinp3Q499E0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Brinp3Q499E0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Brinp3Q499E0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Brinp3Q499E0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Brinp3Q499E0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Brinp3Q499E0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Brinp3Q499E0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Brinp3Q499E0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Brinp3Q499E0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Brinp3Q499E0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Brinp3Q499E0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Brinp3Q499E0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Brinp3Q499E0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Brinp3Q499E0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Brinp3Q499E0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Brinp3Q499E0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Brinp3Q499E0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Brinp3Q499E0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Brinp3Q499E0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Brinp3Q499E0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Brinp3Q499E0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Brinp3Q499E0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Brinp3Q499E0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Brinp3Q499E0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Brinp3Q499E0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Brinp3Q499E0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Brinp3Q499E0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Brinp3Q499E0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Brinp3Q499E0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Brinp3Q499E0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Brinp3Q499E0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Brinp3Q499E0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Brinp3Q499E0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Brinp3Q499E0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Brinp3Q499E0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Brinp3Q499E0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Brinp3Q499E0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Brinp3Q499E0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Brinp3Q499E0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Brinp3Q499E0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Brinp3Q499E0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Brinp3Q499E0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Brinp3Q499E0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Brinp3Q499E0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Brinp3Q499E0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Brinp3Q499E0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Brinp3Q499E0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Brinp3Q499E0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Brinp3Q499E0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Brinp3Q499E0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Brinp3Q499E0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Brinp3Q499E0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Brinp3Q499E0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Brinp3Q499E0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Brinp3Q499E0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Brinp3Q499E0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Brinp3Q499E0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Brinp3Q499E0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Brinp3Q499E0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Brinp3Q499E0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Brinp3Q499E0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Brinp3Q499E0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Brinp3Q499E0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Brinp3Q499E0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Brinp3Q499E0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Brinp3Q499E0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
Brinp3Q499E0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Brinp3Q499E0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Brinp3Q499E0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Brinp3Q499E0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Brinp3Q499E0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Brinp3Q499E0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Brinp3Q499E0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Brinp3Q499E0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Brinp3Q499E0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Brinp3Q499E0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Brinp3Q499E0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Brinp3Q499E0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Brinp3Q499E0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Brinp3Q499E0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Brinp3Q499E0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Brinp3Q499E0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Brinp3Q499E0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Brinp3Q499E0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Brinp3Q499E0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Brinp3Q499E0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Brinp3Q499E0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Brinp3Q499E0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Brinp3Q499E0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Brinp3Q499E0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Brinp3Q499E0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Brinp3Q499E0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Brinp3Q499E0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Brinp3Q499E0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Brinp3Q499E0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Brinp3Q499E0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Brinp3Q499E0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms