Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2al1nQ497L1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2al1nQ497L1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2al1nQ497L1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2al1nQ497L1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
H2al1nQ497L1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2al1nQ497L1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2al1nQ497L1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2al1nQ497L1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2al1nQ497L1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2al1nQ497L1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2al1nQ497L1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2al1nQ497L1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2al1nQ497L1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2al1nQ497L1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2al1nQ497L1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2al1nQ497L1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2al1nQ497L1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2al1nQ497L1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2al1nQ497L1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2al1nQ497L1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2al1nQ497L1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2al1nQ497L1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2al1nQ497L1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
H2al1nQ497L1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
H2al1nQ497L1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2al1nQ497L1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2al1nQ497L1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2al1nQ497L1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2al1nQ497L1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2al1nQ497L1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2al1nQ497L1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2al1nQ497L1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2al1nQ497L1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2al1nQ497L1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2al1nQ497L1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2al1nQ497L1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2al1nQ497L1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2al1nQ497L1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
H2al1nQ497L1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2al1nQ497L1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2al1nQ497L1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2al1nQ497L1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2al1nQ497L1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2al1nQ497L1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2al1nQ497L1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2al1nQ497L1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2al1nQ497L1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2al1nQ497L1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2al1nQ497L1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2al1nQ497L1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2al1nQ497L1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2al1nQ497L1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2al1nQ497L1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2al1nQ497L1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2al1nQ497L1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2al1nQ497L1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2al1nQ497L1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2al1nQ497L1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2al1nQ497L1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2al1nQ497L1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2al1nQ497L1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2al1nQ497L1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2al1nQ497L1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2al1nQ497L1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2al1nQ497L1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2al1nQ497L1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2al1nQ497L1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2al1nQ497L1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2al1nQ497L1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2al1nQ497L1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2al1nQ497L1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2al1nQ497L1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2al1nQ497L1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2al1nQ497L1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2al1nQ497L1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2al1nQ497L1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2al1nQ497L1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2al1nQ497L1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2al1nQ497L1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2al1nQ497L1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2al1nQ497L1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2al1nQ497L1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2al1nQ497L1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2al1nQ497L1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2al1nQ497L1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2al1nQ497L1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2al1nQ497L1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2al1nQ497L1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2al1nQ497L1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2al1nQ497L1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2al1nQ497L1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2al1nQ497L1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2al1nQ497L1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2al1nQ497L1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2al1nQ497L1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2al1nQ497L1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2al1nQ497L1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2al1nQ497L1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2al1nQ497L1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms