Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx25Q3ZT31 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx25Q3ZT31 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx25Q3ZT31 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx25Q3ZT31 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx25Q3ZT31 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx25Q3ZT31 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snx25Q3ZT31 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snx25Q3ZT31 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snx25Q3ZT31 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snx25Q3ZT31 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snx25Q3ZT31 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snx25Q3ZT31 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Snx25Q3ZT31 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Snx25Q3ZT31 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snx25Q3ZT31 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snx25Q3ZT31 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx25Q3ZT31 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx25Q3ZT31 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx25Q3ZT31 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx25Q3ZT31 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx25Q3ZT31 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx25Q3ZT31 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx25Q3ZT31 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx25Q3ZT31 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx25Q3ZT31 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx25Q3ZT31 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx25Q3ZT31 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx25Q3ZT31 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx25Q3ZT31 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snx25Q3ZT31 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snx25Q3ZT31 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snx25Q3ZT31 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snx25Q3ZT31 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snx25Q3ZT31 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx25Q3ZT31 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx25Q3ZT31 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx25Q3ZT31 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx25Q3ZT31 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx25Q3ZT31 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx25Q3ZT31 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snx25Q3ZT31 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Snx25Q3ZT31 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snx25Q3ZT31 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Snx25Q3ZT31 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snx25Q3ZT31 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snx25Q3ZT31 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Snx25Q3ZT31 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snx25Q3ZT31 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snx25Q3ZT31 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snx25Q3ZT31 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snx25Q3ZT31 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snx25Q3ZT31 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snx25Q3ZT31 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snx25Q3ZT31 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx25Q3ZT31 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx25Q3ZT31 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx25Q3ZT31 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx25Q3ZT31 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx25Q3ZT31 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx25Q3ZT31 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx25Q3ZT31 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snx25Q3ZT31 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snx25Q3ZT31 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snx25Q3ZT31 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snx25Q3ZT31 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snx25Q3ZT31 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snx25Q3ZT31 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snx25Q3ZT31 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snx25Q3ZT31 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snx25Q3ZT31 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Snx25Q3ZT31 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snx25Q3ZT31 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snx25Q3ZT31 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Snx25Q3ZT31 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snx25Q3ZT31 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snx25Q3ZT31 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snx25Q3ZT31 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snx25Q3ZT31 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snx25Q3ZT31 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snx25Q3ZT31 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Snx25Q3ZT31 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snx25Q3ZT31 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snx25Q3ZT31 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snx25Q3ZT31 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snx25Q3ZT31 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snx25Q3ZT31 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snx25Q3ZT31 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snx25Q3ZT31 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snx25Q3ZT31 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snx25Q3ZT31 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snx25Q3ZT31 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snx25Q3ZT31 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Snx25Q3ZT31 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Snx25Q3ZT31 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snx25Q3ZT31 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snx25Q3ZT31 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snx25Q3ZT31 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snx25Q3ZT31 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snx25Q3ZT31 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms