Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q1

Dnah12, Dynein heavy chain 12, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 3,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah12Q3V0Q1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dnah12Q3V0Q1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dnah12Q3V0Q1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dnah12Q3V0Q1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dnah12Q3V0Q1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dnah12Q3V0Q1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dnah12Q3V0Q1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dnah12Q3V0Q1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dnah12Q3V0Q1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dnah12Q3V0Q1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dnah12Q3V0Q1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Dnah12Q3V0Q1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Dnah12Q3V0Q1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dnah12Q3V0Q1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dnah12Q3V0Q1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dnah12Q3V0Q1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dnah12Q3V0Q1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Dnah12Q3V0Q1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dnah12Q3V0Q1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dnah12Q3V0Q1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dnah12Q3V0Q1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Dnah12Q3V0Q1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dnah12Q3V0Q1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dnah12Q3V0Q1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dnah12Q3V0Q1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dnah12Q3V0Q1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dnah12Q3V0Q1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dnah12Q3V0Q1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dnah12Q3V0Q1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dnah12Q3V0Q1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dnah12Q3V0Q1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Dnah12Q3V0Q1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dnah12Q3V0Q1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dnah12Q3V0Q1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Dnah12Q3V0Q1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dnah12Q3V0Q1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dnah12Q3V0Q1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dnah12Q3V0Q1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dnah12Q3V0Q1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dnah12Q3V0Q1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dnah12Q3V0Q1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dnah12Q3V0Q1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dnah12Q3V0Q1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dnah12Q3V0Q1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dnah12Q3V0Q1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dnah12Q3V0Q1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Dnah12Q3V0Q1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dnah12Q3V0Q1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dnah12Q3V0Q1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dnah12Q3V0Q1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dnah12Q3V0Q1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dnah12Q3V0Q1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dnah12Q3V0Q1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dnah12Q3V0Q1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dnah12Q3V0Q1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dnah12Q3V0Q1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Dnah12Q3V0Q1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dnah12Q3V0Q1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Dnah12Q3V0Q1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dnah12Q3V0Q1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dnah12Q3V0Q1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Dnah12Q3V0Q1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dnah12Q3V0Q1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dnah12Q3V0Q1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dnah12Q3V0Q1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Dnah12Q3V0Q1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dnah12Q3V0Q1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dnah12Q3V0Q1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dnah12Q3V0Q1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dnah12Q3V0Q1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dnah12Q3V0Q1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dnah12Q3V0Q1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dnah12Q3V0Q1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dnah12Q3V0Q1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dnah12Q3V0Q1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dnah12Q3V0Q1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dnah12Q3V0Q1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dnah12Q3V0Q1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dnah12Q3V0Q1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dnah12Q3V0Q1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dnah12Q3V0Q1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Dnah12Q3V0Q1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dnah12Q3V0Q1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dnah12Q3V0Q1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dnah12Q3V0Q1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dnah12Q3V0Q1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dnah12Q3V0Q1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dnah12Q3V0Q1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dnah12Q3V0Q1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dnah12Q3V0Q1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dnah12Q3V0Q1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Dnah12Q3V0Q1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dnah12Q3V0Q1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dnah12Q3V0Q1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dnah12Q3V0Q1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Dnah12Q3V0Q1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dnah12Q3V0Q1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dnah12Q3V0Q1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dnah12Q3V0Q1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dnah12Q3V0Q1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms