Protein–RNA interactions for Protein: Q3V016

Hipk4, Homeodomain-interacting protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk4Q3V016 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hipk4Q3V016 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hipk4Q3V016 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hipk4Q3V016 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hipk4Q3V016 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hipk4Q3V016 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hipk4Q3V016 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hipk4Q3V016 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hipk4Q3V016 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hipk4Q3V016 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hipk4Q3V016 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hipk4Q3V016 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hipk4Q3V016 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hipk4Q3V016 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hipk4Q3V016 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hipk4Q3V016 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hipk4Q3V016 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hipk4Q3V016 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hipk4Q3V016 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hipk4Q3V016 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hipk4Q3V016 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hipk4Q3V016 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hipk4Q3V016 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hipk4Q3V016 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hipk4Q3V016 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hipk4Q3V016 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Hipk4Q3V016 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Hipk4Q3V016 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hipk4Q3V016 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hipk4Q3V016 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hipk4Q3V016 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hipk4Q3V016 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hipk4Q3V016 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hipk4Q3V016 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hipk4Q3V016 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hipk4Q3V016 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hipk4Q3V016 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Hipk4Q3V016 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hipk4Q3V016 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hipk4Q3V016 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hipk4Q3V016 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hipk4Q3V016 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hipk4Q3V016 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hipk4Q3V016 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hipk4Q3V016 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hipk4Q3V016 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Hipk4Q3V016 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hipk4Q3V016 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hipk4Q3V016 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hipk4Q3V016 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hipk4Q3V016 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hipk4Q3V016 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hipk4Q3V016 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Hipk4Q3V016 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hipk4Q3V016 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hipk4Q3V016 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hipk4Q3V016 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hipk4Q3V016 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Hipk4Q3V016 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hipk4Q3V016 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hipk4Q3V016 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hipk4Q3V016 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hipk4Q3V016 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hipk4Q3V016 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hipk4Q3V016 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Hipk4Q3V016 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hipk4Q3V016 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hipk4Q3V016 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hipk4Q3V016 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Hipk4Q3V016 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hipk4Q3V016 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hipk4Q3V016 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hipk4Q3V016 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hipk4Q3V016 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hipk4Q3V016 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hipk4Q3V016 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hipk4Q3V016 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hipk4Q3V016 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hipk4Q3V016 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hipk4Q3V016 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hipk4Q3V016 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hipk4Q3V016 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hipk4Q3V016 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hipk4Q3V016 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Hipk4Q3V016 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hipk4Q3V016 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hipk4Q3V016 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hipk4Q3V016 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hipk4Q3V016 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hipk4Q3V016 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hipk4Q3V016 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hipk4Q3V016 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hipk4Q3V016 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hipk4Q3V016 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Hipk4Q3V016 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hipk4Q3V016 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hipk4Q3V016 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hipk4Q3V016 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hipk4Q3V016 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hipk4Q3V016 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms