Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ39

Lrrfip1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrfip1Q3UZ39 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrrfip1Q3UZ39 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrrfip1Q3UZ39 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Lrrfip1Q3UZ39 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrrfip1Q3UZ39 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrrfip1Q3UZ39 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrrfip1Q3UZ39 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrrfip1Q3UZ39 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrrfip1Q3UZ39 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrrfip1Q3UZ39 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrrfip1Q3UZ39 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrrfip1Q3UZ39 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrrfip1Q3UZ39 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrrfip1Q3UZ39 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrrfip1Q3UZ39 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrrfip1Q3UZ39 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrrfip1Q3UZ39 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrrfip1Q3UZ39 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrrfip1Q3UZ39 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrrfip1Q3UZ39 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrrfip1Q3UZ39 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrrfip1Q3UZ39 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrrfip1Q3UZ39 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrrfip1Q3UZ39 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrrfip1Q3UZ39 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrrfip1Q3UZ39 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrrfip1Q3UZ39 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrrfip1Q3UZ39 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrrfip1Q3UZ39 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrrfip1Q3UZ39 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrrfip1Q3UZ39 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrrfip1Q3UZ39 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrrfip1Q3UZ39 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrrfip1Q3UZ39 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrrfip1Q3UZ39 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrrfip1Q3UZ39 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrrfip1Q3UZ39 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrrfip1Q3UZ39 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrrfip1Q3UZ39 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrrfip1Q3UZ39 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrrfip1Q3UZ39 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrrfip1Q3UZ39 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrrfip1Q3UZ39 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrrfip1Q3UZ39 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrrfip1Q3UZ39 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrrfip1Q3UZ39 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrrfip1Q3UZ39 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrrfip1Q3UZ39 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrrfip1Q3UZ39 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrrfip1Q3UZ39 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrrfip1Q3UZ39 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrrfip1Q3UZ39 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrrfip1Q3UZ39 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrfip1Q3UZ39 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrfip1Q3UZ39 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrfip1Q3UZ39 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrfip1Q3UZ39 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrfip1Q3UZ39 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrfip1Q3UZ39 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrfip1Q3UZ39 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrfip1Q3UZ39 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrfip1Q3UZ39 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrfip1Q3UZ39 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrfip1Q3UZ39 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrfip1Q3UZ39 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrfip1Q3UZ39 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrfip1Q3UZ39 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrfip1Q3UZ39 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrfip1Q3UZ39 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrfip1Q3UZ39 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrfip1Q3UZ39 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrrfip1Q3UZ39 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrrfip1Q3UZ39 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrrfip1Q3UZ39 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrrfip1Q3UZ39 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrrfip1Q3UZ39 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrfip1Q3UZ39 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrfip1Q3UZ39 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrfip1Q3UZ39 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrfip1Q3UZ39 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrrfip1Q3UZ39 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrrfip1Q3UZ39 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrrfip1Q3UZ39 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrrfip1Q3UZ39 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrfip1Q3UZ39 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrfip1Q3UZ39 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrfip1Q3UZ39 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrfip1Q3UZ39 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrfip1Q3UZ39 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrfip1Q3UZ39 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrfip1Q3UZ39 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrfip1Q3UZ39 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrfip1Q3UZ39 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrfip1Q3UZ39 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrfip1Q3UZ39 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrfip1Q3UZ39 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrfip1Q3UZ39 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrfip1Q3UZ39 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms