Protein–RNA interactions for Protein: Q3USQ7

Syndig1l, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1lQ3USQ7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syndig1lQ3USQ7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syndig1lQ3USQ7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syndig1lQ3USQ7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syndig1lQ3USQ7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syndig1lQ3USQ7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syndig1lQ3USQ7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syndig1lQ3USQ7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Syndig1lQ3USQ7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syndig1lQ3USQ7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syndig1lQ3USQ7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syndig1lQ3USQ7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syndig1lQ3USQ7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syndig1lQ3USQ7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syndig1lQ3USQ7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syndig1lQ3USQ7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syndig1lQ3USQ7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syndig1lQ3USQ7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syndig1lQ3USQ7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syndig1lQ3USQ7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syndig1lQ3USQ7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syndig1lQ3USQ7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syndig1lQ3USQ7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syndig1lQ3USQ7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syndig1lQ3USQ7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syndig1lQ3USQ7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Syndig1lQ3USQ7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syndig1lQ3USQ7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Syndig1lQ3USQ7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Syndig1lQ3USQ7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Syndig1lQ3USQ7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Syndig1lQ3USQ7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Syndig1lQ3USQ7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Syndig1lQ3USQ7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syndig1lQ3USQ7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syndig1lQ3USQ7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syndig1lQ3USQ7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syndig1lQ3USQ7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syndig1lQ3USQ7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syndig1lQ3USQ7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syndig1lQ3USQ7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syndig1lQ3USQ7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Syndig1lQ3USQ7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syndig1lQ3USQ7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syndig1lQ3USQ7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Syndig1lQ3USQ7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syndig1lQ3USQ7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syndig1lQ3USQ7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syndig1lQ3USQ7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syndig1lQ3USQ7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syndig1lQ3USQ7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syndig1lQ3USQ7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syndig1lQ3USQ7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syndig1lQ3USQ7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syndig1lQ3USQ7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syndig1lQ3USQ7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syndig1lQ3USQ7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syndig1lQ3USQ7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syndig1lQ3USQ7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syndig1lQ3USQ7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syndig1lQ3USQ7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syndig1lQ3USQ7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syndig1lQ3USQ7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syndig1lQ3USQ7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syndig1lQ3USQ7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Syndig1lQ3USQ7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syndig1lQ3USQ7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syndig1lQ3USQ7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syndig1lQ3USQ7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syndig1lQ3USQ7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syndig1lQ3USQ7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syndig1lQ3USQ7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syndig1lQ3USQ7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Syndig1lQ3USQ7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Syndig1lQ3USQ7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Syndig1lQ3USQ7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Syndig1lQ3USQ7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Syndig1lQ3USQ7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Syndig1lQ3USQ7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Syndig1lQ3USQ7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Syndig1lQ3USQ7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syndig1lQ3USQ7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syndig1lQ3USQ7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syndig1lQ3USQ7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syndig1lQ3USQ7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syndig1lQ3USQ7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syndig1lQ3USQ7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syndig1lQ3USQ7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syndig1lQ3USQ7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syndig1lQ3USQ7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syndig1lQ3USQ7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syndig1lQ3USQ7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syndig1lQ3USQ7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syndig1lQ3USQ7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syndig1lQ3USQ7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syndig1lQ3USQ7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syndig1lQ3USQ7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syndig1lQ3USQ7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syndig1lQ3USQ7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syndig1lQ3USQ7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms