Protein–RNA interactions for Protein: Q3USL1

Klhdc9, Kelch domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc9Q3USL1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Klhdc9Q3USL1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Klhdc9Q3USL1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Klhdc9Q3USL1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Klhdc9Q3USL1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Klhdc9Q3USL1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Klhdc9Q3USL1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Klhdc9Q3USL1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Klhdc9Q3USL1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Klhdc9Q3USL1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Klhdc9Q3USL1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Klhdc9Q3USL1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Klhdc9Q3USL1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Klhdc9Q3USL1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Klhdc9Q3USL1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Klhdc9Q3USL1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Klhdc9Q3USL1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Klhdc9Q3USL1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Klhdc9Q3USL1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Klhdc9Q3USL1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Klhdc9Q3USL1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Klhdc9Q3USL1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Klhdc9Q3USL1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Klhdc9Q3USL1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Klhdc9Q3USL1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Klhdc9Q3USL1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Klhdc9Q3USL1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Klhdc9Q3USL1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Klhdc9Q3USL1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Klhdc9Q3USL1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Klhdc9Q3USL1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Klhdc9Q3USL1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Klhdc9Q3USL1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Klhdc9Q3USL1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Klhdc9Q3USL1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Klhdc9Q3USL1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Klhdc9Q3USL1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Klhdc9Q3USL1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Klhdc9Q3USL1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Klhdc9Q3USL1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Klhdc9Q3USL1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Klhdc9Q3USL1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Klhdc9Q3USL1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Klhdc9Q3USL1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Klhdc9Q3USL1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Klhdc9Q3USL1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Klhdc9Q3USL1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Klhdc9Q3USL1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Klhdc9Q3USL1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Klhdc9Q3USL1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Klhdc9Q3USL1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Klhdc9Q3USL1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Klhdc9Q3USL1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Klhdc9Q3USL1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Klhdc9Q3USL1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Klhdc9Q3USL1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Klhdc9Q3USL1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Klhdc9Q3USL1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Klhdc9Q3USL1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Klhdc9Q3USL1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Klhdc9Q3USL1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Klhdc9Q3USL1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Klhdc9Q3USL1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Klhdc9Q3USL1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Klhdc9Q3USL1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Klhdc9Q3USL1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Klhdc9Q3USL1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Klhdc9Q3USL1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Klhdc9Q3USL1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Klhdc9Q3USL1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Klhdc9Q3USL1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Klhdc9Q3USL1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Klhdc9Q3USL1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Klhdc9Q3USL1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Klhdc9Q3USL1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Klhdc9Q3USL1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Klhdc9Q3USL1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Klhdc9Q3USL1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Klhdc9Q3USL1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Klhdc9Q3USL1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Klhdc9Q3USL1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Klhdc9Q3USL1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Klhdc9Q3USL1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Klhdc9Q3USL1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Klhdc9Q3USL1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Klhdc9Q3USL1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Klhdc9Q3USL1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Klhdc9Q3USL1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Klhdc9Q3USL1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Klhdc9Q3USL1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Klhdc9Q3USL1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Klhdc9Q3USL1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Klhdc9Q3USL1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Klhdc9Q3USL1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Klhdc9Q3USL1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Klhdc9Q3USL1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Klhdc9Q3USL1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Klhdc9Q3USL1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Klhdc9Q3USL1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Klhdc9Q3USL1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms