Protein–RNA interactions for Protein: Q3US16

Tceanc, Transcription elongation factor A N-terminal and central domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TceancQ3US16 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TceancQ3US16 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TceancQ3US16 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TceancQ3US16 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TceancQ3US16 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TceancQ3US16 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TceancQ3US16 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TceancQ3US16 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TceancQ3US16 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TceancQ3US16 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TceancQ3US16 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TceancQ3US16 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TceancQ3US16 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TceancQ3US16 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TceancQ3US16 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TceancQ3US16 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TceancQ3US16 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TceancQ3US16 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TceancQ3US16 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TceancQ3US16 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TceancQ3US16 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TceancQ3US16 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TceancQ3US16 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TceancQ3US16 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TceancQ3US16 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TceancQ3US16 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TceancQ3US16 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TceancQ3US16 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TceancQ3US16 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TceancQ3US16 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TceancQ3US16 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TceancQ3US16 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TceancQ3US16 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TceancQ3US16 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TceancQ3US16 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TceancQ3US16 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TceancQ3US16 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TceancQ3US16 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TceancQ3US16 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TceancQ3US16 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TceancQ3US16 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TceancQ3US16 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TceancQ3US16 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TceancQ3US16 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TceancQ3US16 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TceancQ3US16 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TceancQ3US16 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TceancQ3US16 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TceancQ3US16 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TceancQ3US16 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TceancQ3US16 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TceancQ3US16 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TceancQ3US16 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TceancQ3US16 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TceancQ3US16 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TceancQ3US16 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TceancQ3US16 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TceancQ3US16 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TceancQ3US16 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TceancQ3US16 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TceancQ3US16 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TceancQ3US16 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TceancQ3US16 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TceancQ3US16 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TceancQ3US16 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TceancQ3US16 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TceancQ3US16 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TceancQ3US16 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TceancQ3US16 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TceancQ3US16 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TceancQ3US16 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TceancQ3US16 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TceancQ3US16 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TceancQ3US16 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TceancQ3US16 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TceancQ3US16 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TceancQ3US16 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TceancQ3US16 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TceancQ3US16 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TceancQ3US16 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TceancQ3US16 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TceancQ3US16 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TceancQ3US16 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TceancQ3US16 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TceancQ3US16 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TceancQ3US16 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TceancQ3US16 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TceancQ3US16 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TceancQ3US16 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TceancQ3US16 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TceancQ3US16 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TceancQ3US16 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TceancQ3US16 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TceancQ3US16 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TceancQ3US16 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TceancQ3US16 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TceancQ3US16 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TceancQ3US16 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TceancQ3US16 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TceancQ3US16 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms