Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nhlrc4Q3UP44 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nhlrc4Q3UP44 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Nhlrc4Q3UP44 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nhlrc4Q3UP44 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nhlrc4Q3UP44 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nhlrc4Q3UP44 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nhlrc4Q3UP44 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nhlrc4Q3UP44 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nhlrc4Q3UP44 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nhlrc4Q3UP44 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nhlrc4Q3UP44 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nhlrc4Q3UP44 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nhlrc4Q3UP44 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nhlrc4Q3UP44 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nhlrc4Q3UP44 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nhlrc4Q3UP44 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nhlrc4Q3UP44 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nhlrc4Q3UP44 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nhlrc4Q3UP44 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nhlrc4Q3UP44 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nhlrc4Q3UP44 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nhlrc4Q3UP44 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nhlrc4Q3UP44 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Nhlrc4Q3UP44 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nhlrc4Q3UP44 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nhlrc4Q3UP44 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nhlrc4Q3UP44 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nhlrc4Q3UP44 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nhlrc4Q3UP44 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nhlrc4Q3UP44 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nhlrc4Q3UP44 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Nhlrc4Q3UP44 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nhlrc4Q3UP44 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nhlrc4Q3UP44 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nhlrc4Q3UP44 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nhlrc4Q3UP44 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nhlrc4Q3UP44 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nhlrc4Q3UP44 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Nhlrc4Q3UP44 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nhlrc4Q3UP44 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nhlrc4Q3UP44 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nhlrc4Q3UP44 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nhlrc4Q3UP44 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nhlrc4Q3UP44 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nhlrc4Q3UP44 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nhlrc4Q3UP44 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nhlrc4Q3UP44 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nhlrc4Q3UP44 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nhlrc4Q3UP44 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nhlrc4Q3UP44 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nhlrc4Q3UP44 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nhlrc4Q3UP44 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nhlrc4Q3UP44 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nhlrc4Q3UP44 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nhlrc4Q3UP44 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nhlrc4Q3UP44 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nhlrc4Q3UP44 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nhlrc4Q3UP44 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nhlrc4Q3UP44 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nhlrc4Q3UP44 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Nhlrc4Q3UP44 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nhlrc4Q3UP44 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nhlrc4Q3UP44 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Nhlrc4Q3UP44 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nhlrc4Q3UP44 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nhlrc4Q3UP44 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nhlrc4Q3UP44 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Nhlrc4Q3UP44 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nhlrc4Q3UP44 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nhlrc4Q3UP44 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nhlrc4Q3UP44 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nhlrc4Q3UP44 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Nhlrc4Q3UP44 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nhlrc4Q3UP44 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nhlrc4Q3UP44 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nhlrc4Q3UP44 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nhlrc4Q3UP44 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nhlrc4Q3UP44 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nhlrc4Q3UP44 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nhlrc4Q3UP44 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nhlrc4Q3UP44 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nhlrc4Q3UP44 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nhlrc4Q3UP44 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nhlrc4Q3UP44 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nhlrc4Q3UP44 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nhlrc4Q3UP44 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nhlrc4Q3UP44 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nhlrc4Q3UP44 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nhlrc4Q3UP44 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nhlrc4Q3UP44 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nhlrc4Q3UP44 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nhlrc4Q3UP44 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Nhlrc4Q3UP44 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Nhlrc4Q3UP44 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nhlrc4Q3UP44 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nhlrc4Q3UP44 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nhlrc4Q3UP44 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nhlrc4Q3UP44 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nhlrc4Q3UP44 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms