Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMW8

Cln5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln5Q3UMW8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cln5Q3UMW8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cln5Q3UMW8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cln5Q3UMW8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cln5Q3UMW8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cln5Q3UMW8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cln5Q3UMW8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cln5Q3UMW8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cln5Q3UMW8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cln5Q3UMW8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cln5Q3UMW8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cln5Q3UMW8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cln5Q3UMW8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cln5Q3UMW8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cln5Q3UMW8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cln5Q3UMW8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cln5Q3UMW8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cln5Q3UMW8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cln5Q3UMW8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cln5Q3UMW8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cln5Q3UMW8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cln5Q3UMW8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cln5Q3UMW8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cln5Q3UMW8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cln5Q3UMW8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cln5Q3UMW8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cln5Q3UMW8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cln5Q3UMW8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cln5Q3UMW8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cln5Q3UMW8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cln5Q3UMW8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cln5Q3UMW8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Cln5Q3UMW8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Cln5Q3UMW8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cln5Q3UMW8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cln5Q3UMW8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cln5Q3UMW8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cln5Q3UMW8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cln5Q3UMW8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cln5Q3UMW8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cln5Q3UMW8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cln5Q3UMW8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cln5Q3UMW8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cln5Q3UMW8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cln5Q3UMW8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cln5Q3UMW8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cln5Q3UMW8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cln5Q3UMW8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cln5Q3UMW8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cln5Q3UMW8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cln5Q3UMW8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cln5Q3UMW8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cln5Q3UMW8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cln5Q3UMW8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cln5Q3UMW8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cln5Q3UMW8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cln5Q3UMW8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cln5Q3UMW8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cln5Q3UMW8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cln5Q3UMW8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cln5Q3UMW8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cln5Q3UMW8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cln5Q3UMW8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cln5Q3UMW8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cln5Q3UMW8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cln5Q3UMW8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cln5Q3UMW8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cln5Q3UMW8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cln5Q3UMW8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cln5Q3UMW8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cln5Q3UMW8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cln5Q3UMW8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cln5Q3UMW8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cln5Q3UMW8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cln5Q3UMW8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cln5Q3UMW8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cln5Q3UMW8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cln5Q3UMW8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cln5Q3UMW8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cln5Q3UMW8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Cln5Q3UMW8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cln5Q3UMW8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cln5Q3UMW8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cln5Q3UMW8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cln5Q3UMW8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cln5Q3UMW8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cln5Q3UMW8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cln5Q3UMW8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cln5Q3UMW8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cln5Q3UMW8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cln5Q3UMW8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cln5Q3UMW8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cln5Q3UMW8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cln5Q3UMW8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Cln5Q3UMW8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cln5Q3UMW8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cln5Q3UMW8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cln5Q3UMW8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cln5Q3UMW8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cln5Q3UMW8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms