Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULF4

Spg7, Paraplegin, mousemouse

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spg7Q3ULF4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Spg7Q3ULF4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Spg7Q3ULF4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Spg7Q3ULF4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Spg7Q3ULF4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Spg7Q3ULF4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Spg7Q3ULF4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Spg7Q3ULF4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Spg7Q3ULF4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Spg7Q3ULF4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Spg7Q3ULF4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Spg7Q3ULF4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Spg7Q3ULF4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Spg7Q3ULF4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Spg7Q3ULF4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Spg7Q3ULF4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Spg7Q3ULF4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Spg7Q3ULF4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Spg7Q3ULF4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Spg7Q3ULF4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Spg7Q3ULF4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Spg7Q3ULF4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Spg7Q3ULF4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Spg7Q3ULF4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Spg7Q3ULF4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Spg7Q3ULF4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Spg7Q3ULF4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Spg7Q3ULF4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Spg7Q3ULF4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Spg7Q3ULF4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Spg7Q3ULF4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Spg7Q3ULF4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Spg7Q3ULF4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Spg7Q3ULF4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Spg7Q3ULF4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Spg7Q3ULF4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Spg7Q3ULF4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Spg7Q3ULF4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Spg7Q3ULF4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Spg7Q3ULF4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Spg7Q3ULF4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Spg7Q3ULF4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Spg7Q3ULF4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Spg7Q3ULF4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Spg7Q3ULF4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Spg7Q3ULF4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Spg7Q3ULF4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Spg7Q3ULF4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Spg7Q3ULF4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Spg7Q3ULF4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Spg7Q3ULF4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Spg7Q3ULF4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Spg7Q3ULF4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Spg7Q3ULF4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Spg7Q3ULF4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Spg7Q3ULF4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Spg7Q3ULF4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Spg7Q3ULF4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Spg7Q3ULF4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Spg7Q3ULF4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Spg7Q3ULF4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Spg7Q3ULF4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Spg7Q3ULF4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Spg7Q3ULF4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Spg7Q3ULF4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Spg7Q3ULF4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Spg7Q3ULF4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Spg7Q3ULF4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Spg7Q3ULF4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Spg7Q3ULF4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Spg7Q3ULF4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Spg7Q3ULF4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Spg7Q3ULF4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Spg7Q3ULF4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Spg7Q3ULF4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Spg7Q3ULF4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Spg7Q3ULF4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Spg7Q3ULF4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Spg7Q3ULF4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Spg7Q3ULF4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Spg7Q3ULF4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Spg7Q3ULF4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Spg7Q3ULF4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Spg7Q3ULF4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Spg7Q3ULF4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Spg7Q3ULF4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Spg7Q3ULF4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Spg7Q3ULF4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Spg7Q3ULF4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Spg7Q3ULF4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Spg7Q3ULF4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Spg7Q3ULF4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Spg7Q3ULF4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Spg7Q3ULF4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Spg7Q3ULF4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Spg7Q3ULF4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Spg7Q3ULF4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Spg7Q3ULF4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Spg7Q3ULF4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Spg7Q3ULF4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms