Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CrxosQ3UL53 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CrxosQ3UL53 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CrxosQ3UL53 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CrxosQ3UL53 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CrxosQ3UL53 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CrxosQ3UL53 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CrxosQ3UL53 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CrxosQ3UL53 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CrxosQ3UL53 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CrxosQ3UL53 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CrxosQ3UL53 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CrxosQ3UL53 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CrxosQ3UL53 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CrxosQ3UL53 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CrxosQ3UL53 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CrxosQ3UL53 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CrxosQ3UL53 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CrxosQ3UL53 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CrxosQ3UL53 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CrxosQ3UL53 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CrxosQ3UL53 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CrxosQ3UL53 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CrxosQ3UL53 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CrxosQ3UL53 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CrxosQ3UL53 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CrxosQ3UL53 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CrxosQ3UL53 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CrxosQ3UL53 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CrxosQ3UL53 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CrxosQ3UL53 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CrxosQ3UL53 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CrxosQ3UL53 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CrxosQ3UL53 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CrxosQ3UL53 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CrxosQ3UL53 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CrxosQ3UL53 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CrxosQ3UL53 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CrxosQ3UL53 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CrxosQ3UL53 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CrxosQ3UL53 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CrxosQ3UL53 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CrxosQ3UL53 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CrxosQ3UL53 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CrxosQ3UL53 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CrxosQ3UL53 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CrxosQ3UL53 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CrxosQ3UL53 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CrxosQ3UL53 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CrxosQ3UL53 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CrxosQ3UL53 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CrxosQ3UL53 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CrxosQ3UL53 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CrxosQ3UL53 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CrxosQ3UL53 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CrxosQ3UL53 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CrxosQ3UL53 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CrxosQ3UL53 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CrxosQ3UL53 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CrxosQ3UL53 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CrxosQ3UL53 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CrxosQ3UL53 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CrxosQ3UL53 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CrxosQ3UL53 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CrxosQ3UL53 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CrxosQ3UL53 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CrxosQ3UL53 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CrxosQ3UL53 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CrxosQ3UL53 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CrxosQ3UL53 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CrxosQ3UL53 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CrxosQ3UL53 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CrxosQ3UL53 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CrxosQ3UL53 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CrxosQ3UL53 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CrxosQ3UL53 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CrxosQ3UL53 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CrxosQ3UL53 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CrxosQ3UL53 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CrxosQ3UL53 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CrxosQ3UL53 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CrxosQ3UL53 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CrxosQ3UL53 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CrxosQ3UL53 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CrxosQ3UL53 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CrxosQ3UL53 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CrxosQ3UL53 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CrxosQ3UL53 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CrxosQ3UL53 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CrxosQ3UL53 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CrxosQ3UL53 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CrxosQ3UL53 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CrxosQ3UL53 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CrxosQ3UL53 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CrxosQ3UL53 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CrxosQ3UL53 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CrxosQ3UL53 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CrxosQ3UL53 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CrxosQ3UL53 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CrxosQ3UL53 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.5 ms