Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHK3

Greb1, Protein GREB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Greb1Q3UHK3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Greb1Q3UHK3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Greb1Q3UHK3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Greb1Q3UHK3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Greb1Q3UHK3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Greb1Q3UHK3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Greb1Q3UHK3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Greb1Q3UHK3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Greb1Q3UHK3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Greb1Q3UHK3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Greb1Q3UHK3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Greb1Q3UHK3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Greb1Q3UHK3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Greb1Q3UHK3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Greb1Q3UHK3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Greb1Q3UHK3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Greb1Q3UHK3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Greb1Q3UHK3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Greb1Q3UHK3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Greb1Q3UHK3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Greb1Q3UHK3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Greb1Q3UHK3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Greb1Q3UHK3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Greb1Q3UHK3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Greb1Q3UHK3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Greb1Q3UHK3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Greb1Q3UHK3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Greb1Q3UHK3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Greb1Q3UHK3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Greb1Q3UHK3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Greb1Q3UHK3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Greb1Q3UHK3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Greb1Q3UHK3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Greb1Q3UHK3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Greb1Q3UHK3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Greb1Q3UHK3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Greb1Q3UHK3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Greb1Q3UHK3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Greb1Q3UHK3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Greb1Q3UHK3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Greb1Q3UHK3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Greb1Q3UHK3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Greb1Q3UHK3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Greb1Q3UHK3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Greb1Q3UHK3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Greb1Q3UHK3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Greb1Q3UHK3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Greb1Q3UHK3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Greb1Q3UHK3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Greb1Q3UHK3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Greb1Q3UHK3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Greb1Q3UHK3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Greb1Q3UHK3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Greb1Q3UHK3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Greb1Q3UHK3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Greb1Q3UHK3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Greb1Q3UHK3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Greb1Q3UHK3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Greb1Q3UHK3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Greb1Q3UHK3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Greb1Q3UHK3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Greb1Q3UHK3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Greb1Q3UHK3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Greb1Q3UHK3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Greb1Q3UHK3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Greb1Q3UHK3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Greb1Q3UHK3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Greb1Q3UHK3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Greb1Q3UHK3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Greb1Q3UHK3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Greb1Q3UHK3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Greb1Q3UHK3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Greb1Q3UHK3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Greb1Q3UHK3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Greb1Q3UHK3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Greb1Q3UHK3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Greb1Q3UHK3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Greb1Q3UHK3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Greb1Q3UHK3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Greb1Q3UHK3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Greb1Q3UHK3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Greb1Q3UHK3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Greb1Q3UHK3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Greb1Q3UHK3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Greb1Q3UHK3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Greb1Q3UHK3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Greb1Q3UHK3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Greb1Q3UHK3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Greb1Q3UHK3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Greb1Q3UHK3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Greb1Q3UHK3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Greb1Q3UHK3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Greb1Q3UHK3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Greb1Q3UHK3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Greb1Q3UHK3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Greb1Q3UHK3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Greb1Q3UHK3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Greb1Q3UHK3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Greb1Q3UHK3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Greb1Q3UHK3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms