Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHG7

Lchn, Protein LCHN, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LchnQ3UHG7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LchnQ3UHG7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LchnQ3UHG7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LchnQ3UHG7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LchnQ3UHG7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LchnQ3UHG7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LchnQ3UHG7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LchnQ3UHG7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LchnQ3UHG7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LchnQ3UHG7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LchnQ3UHG7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LchnQ3UHG7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LchnQ3UHG7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LchnQ3UHG7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LchnQ3UHG7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LchnQ3UHG7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LchnQ3UHG7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LchnQ3UHG7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LchnQ3UHG7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LchnQ3UHG7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LchnQ3UHG7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LchnQ3UHG7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LchnQ3UHG7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LchnQ3UHG7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LchnQ3UHG7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LchnQ3UHG7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LchnQ3UHG7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LchnQ3UHG7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LchnQ3UHG7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LchnQ3UHG7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LchnQ3UHG7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LchnQ3UHG7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LchnQ3UHG7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LchnQ3UHG7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LchnQ3UHG7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LchnQ3UHG7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LchnQ3UHG7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LchnQ3UHG7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LchnQ3UHG7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LchnQ3UHG7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LchnQ3UHG7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LchnQ3UHG7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LchnQ3UHG7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LchnQ3UHG7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LchnQ3UHG7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LchnQ3UHG7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LchnQ3UHG7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LchnQ3UHG7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LchnQ3UHG7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LchnQ3UHG7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LchnQ3UHG7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LchnQ3UHG7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LchnQ3UHG7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LchnQ3UHG7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
LchnQ3UHG7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LchnQ3UHG7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LchnQ3UHG7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LchnQ3UHG7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LchnQ3UHG7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LchnQ3UHG7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LchnQ3UHG7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LchnQ3UHG7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LchnQ3UHG7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LchnQ3UHG7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LchnQ3UHG7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LchnQ3UHG7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LchnQ3UHG7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LchnQ3UHG7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LchnQ3UHG7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LchnQ3UHG7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LchnQ3UHG7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LchnQ3UHG7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LchnQ3UHG7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LchnQ3UHG7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LchnQ3UHG7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LchnQ3UHG7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LchnQ3UHG7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LchnQ3UHG7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LchnQ3UHG7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LchnQ3UHG7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LchnQ3UHG7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LchnQ3UHG7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LchnQ3UHG7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LchnQ3UHG7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LchnQ3UHG7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LchnQ3UHG7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LchnQ3UHG7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LchnQ3UHG7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LchnQ3UHG7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LchnQ3UHG7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LchnQ3UHG7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LchnQ3UHG7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LchnQ3UHG7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LchnQ3UHG7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LchnQ3UHG7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LchnQ3UHG7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LchnQ3UHG7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LchnQ3UHG7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LchnQ3UHG7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LchnQ3UHG7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms