Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snx27Q3UHD6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snx27Q3UHD6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snx27Q3UHD6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snx27Q3UHD6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Snx27Q3UHD6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snx27Q3UHD6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snx27Q3UHD6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snx27Q3UHD6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snx27Q3UHD6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snx27Q3UHD6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snx27Q3UHD6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snx27Q3UHD6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snx27Q3UHD6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snx27Q3UHD6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snx27Q3UHD6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snx27Q3UHD6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snx27Q3UHD6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snx27Q3UHD6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snx27Q3UHD6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snx27Q3UHD6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snx27Q3UHD6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snx27Q3UHD6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snx27Q3UHD6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snx27Q3UHD6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Snx27Q3UHD6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Snx27Q3UHD6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snx27Q3UHD6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snx27Q3UHD6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snx27Q3UHD6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snx27Q3UHD6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snx27Q3UHD6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snx27Q3UHD6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snx27Q3UHD6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx27Q3UHD6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx27Q3UHD6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx27Q3UHD6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx27Q3UHD6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx27Q3UHD6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx27Q3UHD6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snx27Q3UHD6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snx27Q3UHD6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snx27Q3UHD6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snx27Q3UHD6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snx27Q3UHD6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snx27Q3UHD6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snx27Q3UHD6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx27Q3UHD6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx27Q3UHD6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx27Q3UHD6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx27Q3UHD6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snx27Q3UHD6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snx27Q3UHD6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snx27Q3UHD6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Snx27Q3UHD6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snx27Q3UHD6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snx27Q3UHD6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snx27Q3UHD6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snx27Q3UHD6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snx27Q3UHD6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snx27Q3UHD6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Snx27Q3UHD6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Snx27Q3UHD6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snx27Q3UHD6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snx27Q3UHD6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snx27Q3UHD6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snx27Q3UHD6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snx27Q3UHD6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snx27Q3UHD6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snx27Q3UHD6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snx27Q3UHD6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snx27Q3UHD6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snx27Q3UHD6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snx27Q3UHD6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snx27Q3UHD6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snx27Q3UHD6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snx27Q3UHD6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snx27Q3UHD6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snx27Q3UHD6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snx27Q3UHD6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snx27Q3UHD6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Snx27Q3UHD6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snx27Q3UHD6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snx27Q3UHD6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snx27Q3UHD6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snx27Q3UHD6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Snx27Q3UHD6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Snx27Q3UHD6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snx27Q3UHD6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snx27Q3UHD6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snx27Q3UHD6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snx27Q3UHD6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snx27Q3UHD6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snx27Q3UHD6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snx27Q3UHD6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snx27Q3UHD6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snx27Q3UHD6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snx27Q3UHD6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snx27Q3UHD6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snx27Q3UHD6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms