Protein–RNA interactions for Protein: Q3UF64

Rnft2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft2Q3UF64 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rnft2Q3UF64 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rnft2Q3UF64 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rnft2Q3UF64 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rnft2Q3UF64 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Rnft2Q3UF64 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rnft2Q3UF64 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rnft2Q3UF64 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rnft2Q3UF64 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rnft2Q3UF64 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rnft2Q3UF64 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rnft2Q3UF64 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rnft2Q3UF64 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rnft2Q3UF64 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rnft2Q3UF64 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rnft2Q3UF64 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnft2Q3UF64 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnft2Q3UF64 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnft2Q3UF64 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnft2Q3UF64 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnft2Q3UF64 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnft2Q3UF64 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnft2Q3UF64 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnft2Q3UF64 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnft2Q3UF64 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnft2Q3UF64 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnft2Q3UF64 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnft2Q3UF64 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnft2Q3UF64 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnft2Q3UF64 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnft2Q3UF64 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnft2Q3UF64 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rnft2Q3UF64 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rnft2Q3UF64 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rnft2Q3UF64 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rnft2Q3UF64 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnft2Q3UF64 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnft2Q3UF64 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnft2Q3UF64 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnft2Q3UF64 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnft2Q3UF64 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnft2Q3UF64 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnft2Q3UF64 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnft2Q3UF64 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnft2Q3UF64 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnft2Q3UF64 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnft2Q3UF64 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnft2Q3UF64 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnft2Q3UF64 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnft2Q3UF64 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnft2Q3UF64 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnft2Q3UF64 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnft2Q3UF64 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnft2Q3UF64 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnft2Q3UF64 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnft2Q3UF64 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnft2Q3UF64 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnft2Q3UF64 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnft2Q3UF64 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnft2Q3UF64 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnft2Q3UF64 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnft2Q3UF64 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnft2Q3UF64 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnft2Q3UF64 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnft2Q3UF64 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnft2Q3UF64 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnft2Q3UF64 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnft2Q3UF64 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnft2Q3UF64 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnft2Q3UF64 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnft2Q3UF64 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnft2Q3UF64 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnft2Q3UF64 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnft2Q3UF64 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnft2Q3UF64 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnft2Q3UF64 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnft2Q3UF64 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnft2Q3UF64 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnft2Q3UF64 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnft2Q3UF64 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnft2Q3UF64 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnft2Q3UF64 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnft2Q3UF64 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnft2Q3UF64 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnft2Q3UF64 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnft2Q3UF64 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnft2Q3UF64 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnft2Q3UF64 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnft2Q3UF64 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnft2Q3UF64 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnft2Q3UF64 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnft2Q3UF64 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnft2Q3UF64 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnft2Q3UF64 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnft2Q3UF64 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnft2Q3UF64 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnft2Q3UF64 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnft2Q3UF64 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnft2Q3UF64 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnft2Q3UF64 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms