Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trip13Q3UA06 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trip13Q3UA06 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trip13Q3UA06 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trip13Q3UA06 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trip13Q3UA06 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trip13Q3UA06 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trip13Q3UA06 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trip13Q3UA06 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trip13Q3UA06 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trip13Q3UA06 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trip13Q3UA06 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trip13Q3UA06 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trip13Q3UA06 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trip13Q3UA06 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Trip13Q3UA06 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trip13Q3UA06 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trip13Q3UA06 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trip13Q3UA06 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trip13Q3UA06 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trip13Q3UA06 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trip13Q3UA06 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Trip13Q3UA06 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trip13Q3UA06 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Trip13Q3UA06 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trip13Q3UA06 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Trip13Q3UA06 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trip13Q3UA06 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trip13Q3UA06 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trip13Q3UA06 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trip13Q3UA06 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trip13Q3UA06 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trip13Q3UA06 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trip13Q3UA06 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trip13Q3UA06 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trip13Q3UA06 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trip13Q3UA06 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trip13Q3UA06 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trip13Q3UA06 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trip13Q3UA06 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trip13Q3UA06 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trip13Q3UA06 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Trip13Q3UA06 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trip13Q3UA06 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trip13Q3UA06 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trip13Q3UA06 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trip13Q3UA06 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trip13Q3UA06 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trip13Q3UA06 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trip13Q3UA06 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trip13Q3UA06 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trip13Q3UA06 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trip13Q3UA06 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Trip13Q3UA06 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trip13Q3UA06 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trip13Q3UA06 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trip13Q3UA06 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trip13Q3UA06 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Trip13Q3UA06 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trip13Q3UA06 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trip13Q3UA06 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trip13Q3UA06 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trip13Q3UA06 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trip13Q3UA06 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trip13Q3UA06 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trip13Q3UA06 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trip13Q3UA06 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trip13Q3UA06 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trip13Q3UA06 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trip13Q3UA06 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Trip13Q3UA06 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trip13Q3UA06 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trip13Q3UA06 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trip13Q3UA06 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trip13Q3UA06 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trip13Q3UA06 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trip13Q3UA06 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trip13Q3UA06 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trip13Q3UA06 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trip13Q3UA06 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trip13Q3UA06 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trip13Q3UA06 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trip13Q3UA06 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trip13Q3UA06 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Trip13Q3UA06 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trip13Q3UA06 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trip13Q3UA06 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trip13Q3UA06 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trip13Q3UA06 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trip13Q3UA06 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trip13Q3UA06 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trip13Q3UA06 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trip13Q3UA06 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Trip13Q3UA06 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trip13Q3UA06 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Trip13Q3UA06 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trip13Q3UA06 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trip13Q3UA06 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trip13Q3UA06 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trip13Q3UA06 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms