Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9G9

Lbr, Lamin-B receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbrQ3U9G9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LbrQ3U9G9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LbrQ3U9G9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LbrQ3U9G9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LbrQ3U9G9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LbrQ3U9G9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LbrQ3U9G9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LbrQ3U9G9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LbrQ3U9G9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LbrQ3U9G9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LbrQ3U9G9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LbrQ3U9G9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LbrQ3U9G9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LbrQ3U9G9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LbrQ3U9G9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LbrQ3U9G9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LbrQ3U9G9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LbrQ3U9G9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LbrQ3U9G9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LbrQ3U9G9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LbrQ3U9G9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LbrQ3U9G9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LbrQ3U9G9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LbrQ3U9G9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LbrQ3U9G9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LbrQ3U9G9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LbrQ3U9G9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LbrQ3U9G9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LbrQ3U9G9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LbrQ3U9G9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LbrQ3U9G9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LbrQ3U9G9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LbrQ3U9G9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LbrQ3U9G9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LbrQ3U9G9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LbrQ3U9G9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LbrQ3U9G9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LbrQ3U9G9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LbrQ3U9G9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LbrQ3U9G9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LbrQ3U9G9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LbrQ3U9G9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LbrQ3U9G9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LbrQ3U9G9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LbrQ3U9G9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LbrQ3U9G9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LbrQ3U9G9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LbrQ3U9G9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LbrQ3U9G9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LbrQ3U9G9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LbrQ3U9G9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LbrQ3U9G9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LbrQ3U9G9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LbrQ3U9G9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LbrQ3U9G9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LbrQ3U9G9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LbrQ3U9G9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
LbrQ3U9G9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LbrQ3U9G9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LbrQ3U9G9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LbrQ3U9G9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LbrQ3U9G9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LbrQ3U9G9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LbrQ3U9G9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LbrQ3U9G9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LbrQ3U9G9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LbrQ3U9G9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LbrQ3U9G9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LbrQ3U9G9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LbrQ3U9G9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LbrQ3U9G9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LbrQ3U9G9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LbrQ3U9G9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LbrQ3U9G9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LbrQ3U9G9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LbrQ3U9G9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LbrQ3U9G9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LbrQ3U9G9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LbrQ3U9G9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LbrQ3U9G9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LbrQ3U9G9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LbrQ3U9G9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LbrQ3U9G9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LbrQ3U9G9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LbrQ3U9G9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LbrQ3U9G9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LbrQ3U9G9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LbrQ3U9G9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LbrQ3U9G9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LbrQ3U9G9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LbrQ3U9G9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LbrQ3U9G9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LbrQ3U9G9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LbrQ3U9G9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LbrQ3U9G9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LbrQ3U9G9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LbrQ3U9G9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LbrQ3U9G9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LbrQ3U9G9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LbrQ3U9G9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms