Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3U595 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3U595 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q3U595 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q3U595 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q3U595 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q3U595 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q3U595 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q3U595 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q3U595 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q3U595 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3U595 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3U595 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3U595 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3U595 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3U595 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3U595 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3U595 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3U595 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3U595 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3U595 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3U595 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3U595 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3U595 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3U595 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3U595 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3U595 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3U595 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3U595 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3U595 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3U595 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3U595 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3U595 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3U595 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3U595 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3U595 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3U595 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3U595 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3U595 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3U595 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3U595 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3U595 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3U595 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3U595 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3U595 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3U595 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3U595 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3U595 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3U595 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3U595 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3U595 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3U595 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3U595 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3U595 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3U595 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3U595 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3U595 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q3U595 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q3U595 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q3U595 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3U595 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3U595 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3U595 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3U595 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3U595 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3U595 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3U595 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3U595 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3U595 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3U595 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3U595 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3U595 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3U595 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3U595 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3U595 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3U595 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3U595 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3U595 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q3U595 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q3U595 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q3U595 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q3U595 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q3U595 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q3U595 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q3U595 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q3U595 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3U595 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3U595 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3U595 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3U595 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3U595 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3U595 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3U595 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3U595 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3U595 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3U595 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3U595 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3U595 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3U595 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Q3U595 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.8 ms